Protein–RNA interactions for Protein: D6REC4

CFAP99, Cilia- and flagella-associated protein 99, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP99D6REC4 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CFAP99D6REC4 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFAP99D6REC4 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFAP99D6REC4 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFAP99D6REC4 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFAP99D6REC4 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFAP99D6REC4 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFAP99D6REC4 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFAP99D6REC4 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFAP99D6REC4 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFAP99D6REC4 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFAP99D6REC4 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CFAP99D6REC4 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CFAP99D6REC4 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFAP99D6REC4 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFAP99D6REC4 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFAP99D6REC4 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFAP99D6REC4 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFAP99D6REC4 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFAP99D6REC4 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFAP99D6REC4 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFAP99D6REC4 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFAP99D6REC4 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFAP99D6REC4 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFAP99D6REC4 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFAP99D6REC4 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFAP99D6REC4 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFAP99D6REC4 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFAP99D6REC4 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFAP99D6REC4 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFAP99D6REC4 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFAP99D6REC4 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFAP99D6REC4 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFAP99D6REC4 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFAP99D6REC4 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFAP99D6REC4 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFAP99D6REC4 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFAP99D6REC4 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFAP99D6REC4 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFAP99D6REC4 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFAP99D6REC4 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CFAP99D6REC4 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFAP99D6REC4 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFAP99D6REC4 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFAP99D6REC4 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFAP99D6REC4 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFAP99D6REC4 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFAP99D6REC4 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFAP99D6REC4 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFAP99D6REC4 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFAP99D6REC4 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CFAP99D6REC4 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFAP99D6REC4 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFAP99D6REC4 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFAP99D6REC4 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFAP99D6REC4 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFAP99D6REC4 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFAP99D6REC4 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFAP99D6REC4 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFAP99D6REC4 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFAP99D6REC4 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFAP99D6REC4 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFAP99D6REC4 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFAP99D6REC4 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFAP99D6REC4 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFAP99D6REC4 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFAP99D6REC4 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFAP99D6REC4 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFAP99D6REC4 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFAP99D6REC4 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFAP99D6REC4 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFAP99D6REC4 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFAP99D6REC4 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFAP99D6REC4 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFAP99D6REC4 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFAP99D6REC4 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFAP99D6REC4 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFAP99D6REC4 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFAP99D6REC4 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFAP99D6REC4 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFAP99D6REC4 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFAP99D6REC4 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFAP99D6REC4 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFAP99D6REC4 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFAP99D6REC4 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFAP99D6REC4 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFAP99D6REC4 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFAP99D6REC4 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFAP99D6REC4 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFAP99D6REC4 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFAP99D6REC4 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFAP99D6REC4 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFAP99D6REC4 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFAP99D6REC4 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFAP99D6REC4 AL691447.1-201ENST00000419456 387 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CFAP99D6REC4 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFAP99D6REC4 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFAP99D6REC4 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFAP99D6REC4 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFAP99D6REC4 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms