Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
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