Protein–RNA interactions for Protein: R4GN57

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R4GN57 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
R4GN57 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
R4GN57 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
R4GN57 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
R4GN57 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
R4GN57 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
R4GN57 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
R4GN57 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
R4GN57 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
R4GN57 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
R4GN57 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
R4GN57 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
R4GN57 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
R4GN57 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
R4GN57 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
R4GN57 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
R4GN57 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
R4GN57 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
R4GN57 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
R4GN57 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
R4GN57 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
R4GN57 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
R4GN57 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
R4GN57 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
R4GN57 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
R4GN57 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
R4GN57 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
R4GN57 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
R4GN57 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
R4GN57 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
R4GN57 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
R4GN57 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
R4GN57 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
R4GN57 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
R4GN57 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
R4GN57 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
R4GN57 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
R4GN57 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
R4GN57 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
R4GN57 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
R4GN57 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
R4GN57 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
R4GN57 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
R4GN57 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
R4GN57 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
R4GN57 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
R4GN57 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
R4GN57 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
R4GN57 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
R4GN57 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
R4GN57 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
R4GN57 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
R4GN57 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
R4GN57 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
R4GN57 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
R4GN57 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
R4GN57 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
R4GN57 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
R4GN57 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
R4GN57 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
R4GN57 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
R4GN57 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
R4GN57 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
R4GN57 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
R4GN57 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
R4GN57 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
R4GN57 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
R4GN57 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
R4GN57 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
R4GN57 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
R4GN57 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
R4GN57 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
R4GN57 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
R4GN57 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
R4GN57 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
R4GN57 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
R4GN57 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
R4GN57 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
R4GN57 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
R4GN57 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
R4GN57 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
R4GN57 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
R4GN57 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
R4GN57 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
R4GN57 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
R4GN57 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
R4GN57 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
R4GN57 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
R4GN57 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
R4GN57 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
R4GN57 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
R4GN57 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
R4GN57 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
R4GN57 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
R4GN57 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
R4GN57 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
R4GN57 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
R4GN57 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
R4GN57 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
R4GN57 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms