Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6N9

USH1C, Harmonin, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USH1CQ9Y6N9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USH1CQ9Y6N9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USH1CQ9Y6N9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USH1CQ9Y6N9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USH1CQ9Y6N9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USH1CQ9Y6N9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USH1CQ9Y6N9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USH1CQ9Y6N9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USH1CQ9Y6N9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USH1CQ9Y6N9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USH1CQ9Y6N9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USH1CQ9Y6N9 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USH1CQ9Y6N9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USH1CQ9Y6N9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USH1CQ9Y6N9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USH1CQ9Y6N9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USH1CQ9Y6N9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USH1CQ9Y6N9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USH1CQ9Y6N9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USH1CQ9Y6N9 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USH1CQ9Y6N9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USH1CQ9Y6N9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USH1CQ9Y6N9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USH1CQ9Y6N9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USH1CQ9Y6N9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USH1CQ9Y6N9 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USH1CQ9Y6N9 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USH1CQ9Y6N9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USH1CQ9Y6N9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USH1CQ9Y6N9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USH1CQ9Y6N9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USH1CQ9Y6N9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USH1CQ9Y6N9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USH1CQ9Y6N9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USH1CQ9Y6N9 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USH1CQ9Y6N9 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USH1CQ9Y6N9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USH1CQ9Y6N9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USH1CQ9Y6N9 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USH1CQ9Y6N9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
USH1CQ9Y6N9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USH1CQ9Y6N9 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USH1CQ9Y6N9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USH1CQ9Y6N9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USH1CQ9Y6N9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USH1CQ9Y6N9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USH1CQ9Y6N9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USH1CQ9Y6N9 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USH1CQ9Y6N9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USH1CQ9Y6N9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USH1CQ9Y6N9 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USH1CQ9Y6N9 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USH1CQ9Y6N9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USH1CQ9Y6N9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USH1CQ9Y6N9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USH1CQ9Y6N9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USH1CQ9Y6N9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USH1CQ9Y6N9 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USH1CQ9Y6N9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USH1CQ9Y6N9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USH1CQ9Y6N9 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USH1CQ9Y6N9 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USH1CQ9Y6N9 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USH1CQ9Y6N9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USH1CQ9Y6N9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USH1CQ9Y6N9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USH1CQ9Y6N9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USH1CQ9Y6N9 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USH1CQ9Y6N9 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USH1CQ9Y6N9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
USH1CQ9Y6N9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USH1CQ9Y6N9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USH1CQ9Y6N9 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USH1CQ9Y6N9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USH1CQ9Y6N9 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USH1CQ9Y6N9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USH1CQ9Y6N9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USH1CQ9Y6N9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USH1CQ9Y6N9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USH1CQ9Y6N9 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USH1CQ9Y6N9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USH1CQ9Y6N9 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USH1CQ9Y6N9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USH1CQ9Y6N9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USH1CQ9Y6N9 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USH1CQ9Y6N9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USH1CQ9Y6N9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USH1CQ9Y6N9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USH1CQ9Y6N9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USH1CQ9Y6N9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USH1CQ9Y6N9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USH1CQ9Y6N9 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USH1CQ9Y6N9 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USH1CQ9Y6N9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USH1CQ9Y6N9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USH1CQ9Y6N9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USH1CQ9Y6N9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
USH1CQ9Y6N9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USH1CQ9Y6N9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USH1CQ9Y6N9 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms