Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6K1

DNMT3A, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3AQ9Y6K1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNMT3AQ9Y6K1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
DNMT3AQ9Y6K1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNMT3AQ9Y6K1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNMT3AQ9Y6K1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNMT3AQ9Y6K1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNMT3AQ9Y6K1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNMT3AQ9Y6K1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNMT3AQ9Y6K1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNMT3AQ9Y6K1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNMT3AQ9Y6K1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
DNMT3AQ9Y6K1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNMT3AQ9Y6K1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNMT3AQ9Y6K1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNMT3AQ9Y6K1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
DNMT3AQ9Y6K1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNMT3AQ9Y6K1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNMT3AQ9Y6K1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNMT3AQ9Y6K1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNMT3AQ9Y6K1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNMT3AQ9Y6K1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNMT3AQ9Y6K1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNMT3AQ9Y6K1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNMT3AQ9Y6K1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNMT3AQ9Y6K1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
DNMT3AQ9Y6K1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNMT3AQ9Y6K1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNMT3AQ9Y6K1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNMT3AQ9Y6K1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNMT3AQ9Y6K1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNMT3AQ9Y6K1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNMT3AQ9Y6K1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
DNMT3AQ9Y6K1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNMT3AQ9Y6K1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNMT3AQ9Y6K1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNMT3AQ9Y6K1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNMT3AQ9Y6K1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
DNMT3AQ9Y6K1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNMT3AQ9Y6K1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNMT3AQ9Y6K1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNMT3AQ9Y6K1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNMT3AQ9Y6K1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNMT3AQ9Y6K1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNMT3AQ9Y6K1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNMT3AQ9Y6K1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNMT3AQ9Y6K1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNMT3AQ9Y6K1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNMT3AQ9Y6K1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNMT3AQ9Y6K1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNMT3AQ9Y6K1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNMT3AQ9Y6K1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DNMT3AQ9Y6K1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
DNMT3AQ9Y6K1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
DNMT3AQ9Y6K1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
DNMT3AQ9Y6K1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DNMT3AQ9Y6K1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
DNMT3AQ9Y6K1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
DNMT3AQ9Y6K1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNMT3AQ9Y6K1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNMT3AQ9Y6K1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNMT3AQ9Y6K1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNMT3AQ9Y6K1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
DNMT3AQ9Y6K1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
DNMT3AQ9Y6K1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNMT3AQ9Y6K1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNMT3AQ9Y6K1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNMT3AQ9Y6K1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNMT3AQ9Y6K1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNMT3AQ9Y6K1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNMT3AQ9Y6K1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNMT3AQ9Y6K1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNMT3AQ9Y6K1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNMT3AQ9Y6K1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNMT3AQ9Y6K1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DNMT3AQ9Y6K1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DNMT3AQ9Y6K1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DNMT3AQ9Y6K1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DNMT3AQ9Y6K1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
DNMT3AQ9Y6K1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
DNMT3AQ9Y6K1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DNMT3AQ9Y6K1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DNMT3AQ9Y6K1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DNMT3AQ9Y6K1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DNMT3AQ9Y6K1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNMT3AQ9Y6K1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNMT3AQ9Y6K1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNMT3AQ9Y6K1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNMT3AQ9Y6K1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNMT3AQ9Y6K1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNMT3AQ9Y6K1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNMT3AQ9Y6K1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNMT3AQ9Y6K1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNMT3AQ9Y6K1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNMT3AQ9Y6K1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNMT3AQ9Y6K1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNMT3AQ9Y6K1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNMT3AQ9Y6K1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNMT3AQ9Y6K1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNMT3AQ9Y6K1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNMT3AQ9Y6K1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms