Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Q9Y3F1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Q9Y3F1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Q9Y3F1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Q9Y3F1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Q9Y3F1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Q9Y3F1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Q9Y3F1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Q9Y3F1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Q9Y3F1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Q9Y3F1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Q9Y3F1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Q9Y3F1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Q9Y3F1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Q9Y3F1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Q9Y3F1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Q9Y3F1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Q9Y3F1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Q9Y3F1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Q9Y3F1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Q9Y3F1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Q9Y3F1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Q9Y3F1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Q9Y3F1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Q9Y3F1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Q9Y3F1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Q9Y3F1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Q9Y3F1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Q9Y3F1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Q9Y3F1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Q9Y3F1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Q9Y3F1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Q9Y3F1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Q9Y3F1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Q9Y3F1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Q9Y3F1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Q9Y3F1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Q9Y3F1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Q9Y3F1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Q9Y3F1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Q9Y3F1 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Q9Y3F1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Q9Y3F1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Q9Y3F1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Q9Y3F1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Q9Y3F1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Q9Y3F1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Q9Y3F1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Q9Y3F1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Q9Y3F1 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Q9Y3F1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Q9Y3F1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Q9Y3F1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Q9Y3F1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Q9Y3F1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Q9Y3F1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Q9Y3F1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Q9Y3F1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Q9Y3F1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Q9Y3F1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Q9Y3F1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Q9Y3F1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Q9Y3F1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Q9Y3F1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Q9Y3F1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Q9Y3F1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Q9Y3F1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Q9Y3F1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Q9Y3F1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Q9Y3F1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Q9Y3F1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Q9Y3F1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Q9Y3F1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Q9Y3F1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Q9Y3F1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Q9Y3F1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Q9Y3F1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Q9Y3F1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Q9Y3F1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Q9Y3F1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Q9Y3F1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Q9Y3F1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Q9Y3F1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Q9Y3F1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Q9Y3F1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Q9Y3F1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Q9Y3F1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Q9Y3F1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Q9Y3F1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Q9Y3F1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Q9Y3F1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Q9Y3F1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Q9Y3F1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Q9Y3F1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Q9Y3F1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Q9Y3F1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Q9Y3F1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Q9Y3F1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Q9Y3F1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Q9Y3F1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms