Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y247

FAM50B, Protein FAM50B, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM50BQ9Y247 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM50BQ9Y247 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM50BQ9Y247 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM50BQ9Y247 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM50BQ9Y247 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM50BQ9Y247 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM50BQ9Y247 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM50BQ9Y247 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM50BQ9Y247 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM50BQ9Y247 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM50BQ9Y247 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM50BQ9Y247 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM50BQ9Y247 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM50BQ9Y247 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM50BQ9Y247 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM50BQ9Y247 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM50BQ9Y247 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM50BQ9Y247 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM50BQ9Y247 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM50BQ9Y247 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM50BQ9Y247 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM50BQ9Y247 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM50BQ9Y247 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM50BQ9Y247 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM50BQ9Y247 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM50BQ9Y247 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM50BQ9Y247 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM50BQ9Y247 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM50BQ9Y247 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM50BQ9Y247 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM50BQ9Y247 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM50BQ9Y247 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM50BQ9Y247 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM50BQ9Y247 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM50BQ9Y247 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM50BQ9Y247 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FAM50BQ9Y247 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FAM50BQ9Y247 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FAM50BQ9Y247 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FAM50BQ9Y247 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FAM50BQ9Y247 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FAM50BQ9Y247 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FAM50BQ9Y247 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM50BQ9Y247 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM50BQ9Y247 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM50BQ9Y247 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM50BQ9Y247 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM50BQ9Y247 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM50BQ9Y247 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM50BQ9Y247 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM50BQ9Y247 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM50BQ9Y247 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM50BQ9Y247 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM50BQ9Y247 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM50BQ9Y247 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM50BQ9Y247 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM50BQ9Y247 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM50BQ9Y247 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM50BQ9Y247 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM50BQ9Y247 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM50BQ9Y247 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM50BQ9Y247 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM50BQ9Y247 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM50BQ9Y247 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM50BQ9Y247 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM50BQ9Y247 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM50BQ9Y247 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM50BQ9Y247 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM50BQ9Y247 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM50BQ9Y247 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM50BQ9Y247 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM50BQ9Y247 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM50BQ9Y247 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM50BQ9Y247 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
FAM50BQ9Y247 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FAM50BQ9Y247 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FAM50BQ9Y247 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FAM50BQ9Y247 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FAM50BQ9Y247 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FAM50BQ9Y247 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FAM50BQ9Y247 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FAM50BQ9Y247 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
FAM50BQ9Y247 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
FAM50BQ9Y247 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FAM50BQ9Y247 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FAM50BQ9Y247 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FAM50BQ9Y247 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FAM50BQ9Y247 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FAM50BQ9Y247 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FAM50BQ9Y247 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FAM50BQ9Y247 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM50BQ9Y247 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM50BQ9Y247 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM50BQ9Y247 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM50BQ9Y247 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM50BQ9Y247 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM50BQ9Y247 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM50BQ9Y247 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM50BQ9Y247 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM50BQ9Y247 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms