Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQL6

HDAC5, Histone deacetylase 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC5Q9UQL6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
HDAC5Q9UQL6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
HDAC5Q9UQL6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
HDAC5Q9UQL6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
HDAC5Q9UQL6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
HDAC5Q9UQL6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
HDAC5Q9UQL6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
HDAC5Q9UQL6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
HDAC5Q9UQL6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
HDAC5Q9UQL6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
HDAC5Q9UQL6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
HDAC5Q9UQL6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
HDAC5Q9UQL6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
HDAC5Q9UQL6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
HDAC5Q9UQL6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
HDAC5Q9UQL6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
HDAC5Q9UQL6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HDAC5Q9UQL6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HDAC5Q9UQL6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
HDAC5Q9UQL6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
HDAC5Q9UQL6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
HDAC5Q9UQL6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
HDAC5Q9UQL6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
HDAC5Q9UQL6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HDAC5Q9UQL6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
HDAC5Q9UQL6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
HDAC5Q9UQL6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
HDAC5Q9UQL6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
HDAC5Q9UQL6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
HDAC5Q9UQL6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
HDAC5Q9UQL6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
HDAC5Q9UQL6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
HDAC5Q9UQL6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
HDAC5Q9UQL6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
HDAC5Q9UQL6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
HDAC5Q9UQL6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
HDAC5Q9UQL6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
HDAC5Q9UQL6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HDAC5Q9UQL6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HDAC5Q9UQL6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HDAC5Q9UQL6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HDAC5Q9UQL6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HDAC5Q9UQL6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HDAC5Q9UQL6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HDAC5Q9UQL6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HDAC5Q9UQL6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
HDAC5Q9UQL6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
HDAC5Q9UQL6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HDAC5Q9UQL6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HDAC5Q9UQL6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
HDAC5Q9UQL6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
HDAC5Q9UQL6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
HDAC5Q9UQL6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
HDAC5Q9UQL6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
HDAC5Q9UQL6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
HDAC5Q9UQL6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
HDAC5Q9UQL6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
HDAC5Q9UQL6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
HDAC5Q9UQL6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
HDAC5Q9UQL6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
HDAC5Q9UQL6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
HDAC5Q9UQL6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
HDAC5Q9UQL6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
HDAC5Q9UQL6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
HDAC5Q9UQL6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
HDAC5Q9UQL6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
HDAC5Q9UQL6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
HDAC5Q9UQL6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
HDAC5Q9UQL6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
HDAC5Q9UQL6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
HDAC5Q9UQL6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
HDAC5Q9UQL6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
HDAC5Q9UQL6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
HDAC5Q9UQL6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
HDAC5Q9UQL6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
HDAC5Q9UQL6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
HDAC5Q9UQL6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
HDAC5Q9UQL6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
HDAC5Q9UQL6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
HDAC5Q9UQL6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
HDAC5Q9UQL6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
HDAC5Q9UQL6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
HDAC5Q9UQL6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
HDAC5Q9UQL6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
HDAC5Q9UQL6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
HDAC5Q9UQL6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
HDAC5Q9UQL6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HDAC5Q9UQL6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HDAC5Q9UQL6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HDAC5Q9UQL6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
HDAC5Q9UQL6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
HDAC5Q9UQL6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
HDAC5Q9UQL6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
HDAC5Q9UQL6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
HDAC5Q9UQL6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
HDAC5Q9UQL6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
HDAC5Q9UQL6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
HDAC5Q9UQL6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
HDAC5Q9UQL6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
HDAC5Q9UQL6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms