Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERVW-1Q9UQF0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERVW-1Q9UQF0 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERVW-1Q9UQF0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERVW-1Q9UQF0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERVW-1Q9UQF0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ERVW-1Q9UQF0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERVW-1Q9UQF0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERVW-1Q9UQF0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERVW-1Q9UQF0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERVW-1Q9UQF0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERVW-1Q9UQF0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERVW-1Q9UQF0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERVW-1Q9UQF0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERVW-1Q9UQF0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERVW-1Q9UQF0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERVW-1Q9UQF0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERVW-1Q9UQF0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERVW-1Q9UQF0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERVW-1Q9UQF0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERVW-1Q9UQF0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERVW-1Q9UQF0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ERVW-1Q9UQF0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERVW-1Q9UQF0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERVW-1Q9UQF0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERVW-1Q9UQF0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERVW-1Q9UQF0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERVW-1Q9UQF0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERVW-1Q9UQF0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERVW-1Q9UQF0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERVW-1Q9UQF0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERVW-1Q9UQF0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERVW-1Q9UQF0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERVW-1Q9UQF0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERVW-1Q9UQF0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERVW-1Q9UQF0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERVW-1Q9UQF0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERVW-1Q9UQF0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERVW-1Q9UQF0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERVW-1Q9UQF0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERVW-1Q9UQF0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERVW-1Q9UQF0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERVW-1Q9UQF0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERVW-1Q9UQF0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERVW-1Q9UQF0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERVW-1Q9UQF0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERVW-1Q9UQF0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERVW-1Q9UQF0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERVW-1Q9UQF0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERVW-1Q9UQF0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERVW-1Q9UQF0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERVW-1Q9UQF0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERVW-1Q9UQF0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERVW-1Q9UQF0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERVW-1Q9UQF0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERVW-1Q9UQF0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERVW-1Q9UQF0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERVW-1Q9UQF0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERVW-1Q9UQF0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERVW-1Q9UQF0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERVW-1Q9UQF0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERVW-1Q9UQF0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERVW-1Q9UQF0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERVW-1Q9UQF0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERVW-1Q9UQF0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERVW-1Q9UQF0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERVW-1Q9UQF0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERVW-1Q9UQF0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERVW-1Q9UQF0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERVW-1Q9UQF0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERVW-1Q9UQF0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERVW-1Q9UQF0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERVW-1Q9UQF0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERVW-1Q9UQF0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERVW-1Q9UQF0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ERVW-1Q9UQF0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ERVW-1Q9UQF0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ERVW-1Q9UQF0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ERVW-1Q9UQF0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERVW-1Q9UQF0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERVW-1Q9UQF0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERVW-1Q9UQF0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERVW-1Q9UQF0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERVW-1Q9UQF0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERVW-1Q9UQF0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERVW-1Q9UQF0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERVW-1Q9UQF0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERVW-1Q9UQF0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERVW-1Q9UQF0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERVW-1Q9UQF0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERVW-1Q9UQF0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERVW-1Q9UQF0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERVW-1Q9UQF0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERVW-1Q9UQF0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ERVW-1Q9UQF0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERVW-1Q9UQF0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERVW-1Q9UQF0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERVW-1Q9UQF0 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ERVW-1Q9UQF0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERVW-1Q9UQF0 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms