Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ05

KCNH4, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH4Q9UQ05 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KCNH4Q9UQ05 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KCNH4Q9UQ05 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KCNH4Q9UQ05 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KCNH4Q9UQ05 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
KCNH4Q9UQ05 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KCNH4Q9UQ05 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KCNH4Q9UQ05 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KCNH4Q9UQ05 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
KCNH4Q9UQ05 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KCNH4Q9UQ05 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
KCNH4Q9UQ05 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
KCNH4Q9UQ05 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KCNH4Q9UQ05 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KCNH4Q9UQ05 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KCNH4Q9UQ05 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KCNH4Q9UQ05 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KCNH4Q9UQ05 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KCNH4Q9UQ05 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
KCNH4Q9UQ05 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KCNH4Q9UQ05 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
KCNH4Q9UQ05 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KCNH4Q9UQ05 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KCNH4Q9UQ05 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KCNH4Q9UQ05 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
KCNH4Q9UQ05 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KCNH4Q9UQ05 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KCNH4Q9UQ05 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KCNH4Q9UQ05 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KCNH4Q9UQ05 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KCNH4Q9UQ05 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KCNH4Q9UQ05 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
KCNH4Q9UQ05 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KCNH4Q9UQ05 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KCNH4Q9UQ05 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KCNH4Q9UQ05 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KCNH4Q9UQ05 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KCNH4Q9UQ05 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KCNH4Q9UQ05 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KCNH4Q9UQ05 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KCNH4Q9UQ05 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KCNH4Q9UQ05 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
KCNH4Q9UQ05 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
KCNH4Q9UQ05 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
KCNH4Q9UQ05 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
KCNH4Q9UQ05 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
KCNH4Q9UQ05 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
KCNH4Q9UQ05 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
KCNH4Q9UQ05 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
KCNH4Q9UQ05 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
KCNH4Q9UQ05 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
KCNH4Q9UQ05 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
KCNH4Q9UQ05 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
KCNH4Q9UQ05 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
KCNH4Q9UQ05 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
KCNH4Q9UQ05 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KCNH4Q9UQ05 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KCNH4Q9UQ05 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KCNH4Q9UQ05 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KCNH4Q9UQ05 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KCNH4Q9UQ05 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KCNH4Q9UQ05 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
KCNH4Q9UQ05 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KCNH4Q9UQ05 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KCNH4Q9UQ05 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KCNH4Q9UQ05 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KCNH4Q9UQ05 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KCNH4Q9UQ05 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
KCNH4Q9UQ05 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KCNH4Q9UQ05 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
KCNH4Q9UQ05 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KCNH4Q9UQ05 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
KCNH4Q9UQ05 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KCNH4Q9UQ05 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KCNH4Q9UQ05 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KCNH4Q9UQ05 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KCNH4Q9UQ05 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KCNH4Q9UQ05 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KCNH4Q9UQ05 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KCNH4Q9UQ05 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KCNH4Q9UQ05 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KCNH4Q9UQ05 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KCNH4Q9UQ05 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KCNH4Q9UQ05 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KCNH4Q9UQ05 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KCNH4Q9UQ05 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KCNH4Q9UQ05 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
KCNH4Q9UQ05 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KCNH4Q9UQ05 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KCNH4Q9UQ05 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
KCNH4Q9UQ05 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
KCNH4Q9UQ05 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
KCNH4Q9UQ05 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
KCNH4Q9UQ05 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
KCNH4Q9UQ05 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KCNH4Q9UQ05 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KCNH4Q9UQ05 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KCNH4Q9UQ05 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KCNH4Q9UQ05 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KCNH4Q9UQ05 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms