Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH7

SNX6, Sorting nexin-6, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX6Q9UNH7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX6Q9UNH7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX6Q9UNH7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX6Q9UNH7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX6Q9UNH7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX6Q9UNH7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX6Q9UNH7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX6Q9UNH7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX6Q9UNH7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX6Q9UNH7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX6Q9UNH7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX6Q9UNH7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX6Q9UNH7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX6Q9UNH7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX6Q9UNH7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX6Q9UNH7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX6Q9UNH7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX6Q9UNH7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX6Q9UNH7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX6Q9UNH7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX6Q9UNH7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX6Q9UNH7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX6Q9UNH7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX6Q9UNH7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX6Q9UNH7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX6Q9UNH7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SNX6Q9UNH7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX6Q9UNH7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX6Q9UNH7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX6Q9UNH7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX6Q9UNH7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX6Q9UNH7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX6Q9UNH7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX6Q9UNH7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX6Q9UNH7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX6Q9UNH7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX6Q9UNH7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX6Q9UNH7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX6Q9UNH7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX6Q9UNH7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX6Q9UNH7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX6Q9UNH7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX6Q9UNH7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX6Q9UNH7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX6Q9UNH7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX6Q9UNH7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX6Q9UNH7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX6Q9UNH7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX6Q9UNH7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX6Q9UNH7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX6Q9UNH7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX6Q9UNH7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX6Q9UNH7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX6Q9UNH7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX6Q9UNH7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX6Q9UNH7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX6Q9UNH7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX6Q9UNH7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX6Q9UNH7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX6Q9UNH7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX6Q9UNH7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX6Q9UNH7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX6Q9UNH7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX6Q9UNH7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX6Q9UNH7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX6Q9UNH7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX6Q9UNH7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX6Q9UNH7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX6Q9UNH7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX6Q9UNH7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX6Q9UNH7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX6Q9UNH7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX6Q9UNH7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX6Q9UNH7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX6Q9UNH7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX6Q9UNH7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX6Q9UNH7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX6Q9UNH7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX6Q9UNH7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX6Q9UNH7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX6Q9UNH7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX6Q9UNH7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX6Q9UNH7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX6Q9UNH7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX6Q9UNH7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX6Q9UNH7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX6Q9UNH7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX6Q9UNH7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX6Q9UNH7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX6Q9UNH7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX6Q9UNH7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX6Q9UNH7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX6Q9UNH7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX6Q9UNH7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX6Q9UNH7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX6Q9UNH7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX6Q9UNH7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX6Q9UNH7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX6Q9UNH7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX6Q9UNH7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms