Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS6

SYNPO2, Synaptopodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPO2Q9UMS6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SYNPO2Q9UMS6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SYNPO2Q9UMS6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SYNPO2Q9UMS6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SYNPO2Q9UMS6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SYNPO2Q9UMS6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SYNPO2Q9UMS6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SYNPO2Q9UMS6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SYNPO2Q9UMS6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SYNPO2Q9UMS6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SYNPO2Q9UMS6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SYNPO2Q9UMS6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SYNPO2Q9UMS6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SYNPO2Q9UMS6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SYNPO2Q9UMS6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SYNPO2Q9UMS6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SYNPO2Q9UMS6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SYNPO2Q9UMS6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SYNPO2Q9UMS6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SYNPO2Q9UMS6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SYNPO2Q9UMS6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SYNPO2Q9UMS6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SYNPO2Q9UMS6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SYNPO2Q9UMS6 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SYNPO2Q9UMS6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SYNPO2Q9UMS6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SYNPO2Q9UMS6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SYNPO2Q9UMS6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SYNPO2Q9UMS6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SYNPO2Q9UMS6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SYNPO2Q9UMS6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SYNPO2Q9UMS6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SYNPO2Q9UMS6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SYNPO2Q9UMS6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SYNPO2Q9UMS6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYNPO2Q9UMS6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYNPO2Q9UMS6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYNPO2Q9UMS6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYNPO2Q9UMS6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYNPO2Q9UMS6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYNPO2Q9UMS6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYNPO2Q9UMS6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYNPO2Q9UMS6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYNPO2Q9UMS6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYNPO2Q9UMS6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYNPO2Q9UMS6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYNPO2Q9UMS6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYNPO2Q9UMS6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYNPO2Q9UMS6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYNPO2Q9UMS6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYNPO2Q9UMS6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYNPO2Q9UMS6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYNPO2Q9UMS6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYNPO2Q9UMS6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYNPO2Q9UMS6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYNPO2Q9UMS6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SYNPO2Q9UMS6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYNPO2Q9UMS6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SYNPO2Q9UMS6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SYNPO2Q9UMS6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SYNPO2Q9UMS6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYNPO2Q9UMS6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYNPO2Q9UMS6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYNPO2Q9UMS6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYNPO2Q9UMS6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYNPO2Q9UMS6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SYNPO2Q9UMS6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYNPO2Q9UMS6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYNPO2Q9UMS6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYNPO2Q9UMS6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYNPO2Q9UMS6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYNPO2Q9UMS6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYNPO2Q9UMS6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYNPO2Q9UMS6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYNPO2Q9UMS6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYNPO2Q9UMS6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYNPO2Q9UMS6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYNPO2Q9UMS6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SYNPO2Q9UMS6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYNPO2Q9UMS6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYNPO2Q9UMS6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYNPO2Q9UMS6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYNPO2Q9UMS6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYNPO2Q9UMS6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYNPO2Q9UMS6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYNPO2Q9UMS6 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYNPO2Q9UMS6 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYNPO2Q9UMS6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYNPO2Q9UMS6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SYNPO2Q9UMS6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYNPO2Q9UMS6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYNPO2Q9UMS6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYNPO2Q9UMS6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYNPO2Q9UMS6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYNPO2Q9UMS6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SYNPO2Q9UMS6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYNPO2Q9UMS6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYNPO2Q9UMS6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SYNPO2Q9UMS6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYNPO2Q9UMS6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms