Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULW8

PADI3, Protein-arginine deiminase type-3, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI3Q9ULW8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PADI3Q9ULW8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PADI3Q9ULW8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PADI3Q9ULW8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PADI3Q9ULW8 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PADI3Q9ULW8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PADI3Q9ULW8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PADI3Q9ULW8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PADI3Q9ULW8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PADI3Q9ULW8 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PADI3Q9ULW8 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PADI3Q9ULW8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PADI3Q9ULW8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PADI3Q9ULW8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PADI3Q9ULW8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PADI3Q9ULW8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PADI3Q9ULW8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PADI3Q9ULW8 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PADI3Q9ULW8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PADI3Q9ULW8 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PADI3Q9ULW8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PADI3Q9ULW8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PADI3Q9ULW8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PADI3Q9ULW8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PADI3Q9ULW8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PADI3Q9ULW8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PADI3Q9ULW8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PADI3Q9ULW8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PADI3Q9ULW8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PADI3Q9ULW8 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PADI3Q9ULW8 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PADI3Q9ULW8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PADI3Q9ULW8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PADI3Q9ULW8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PADI3Q9ULW8 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PADI3Q9ULW8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PADI3Q9ULW8 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PADI3Q9ULW8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PADI3Q9ULW8 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PADI3Q9ULW8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PADI3Q9ULW8 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PADI3Q9ULW8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PADI3Q9ULW8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PADI3Q9ULW8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PADI3Q9ULW8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PADI3Q9ULW8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PADI3Q9ULW8 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PADI3Q9ULW8 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PADI3Q9ULW8 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PADI3Q9ULW8 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PADI3Q9ULW8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PADI3Q9ULW8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PADI3Q9ULW8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PADI3Q9ULW8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PADI3Q9ULW8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PADI3Q9ULW8 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PADI3Q9ULW8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PADI3Q9ULW8 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PADI3Q9ULW8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PADI3Q9ULW8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PADI3Q9ULW8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PADI3Q9ULW8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PADI3Q9ULW8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PADI3Q9ULW8 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PADI3Q9ULW8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PADI3Q9ULW8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PADI3Q9ULW8 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PADI3Q9ULW8 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PADI3Q9ULW8 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PADI3Q9ULW8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PADI3Q9ULW8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PADI3Q9ULW8 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PADI3Q9ULW8 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PADI3Q9ULW8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PADI3Q9ULW8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PADI3Q9ULW8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PADI3Q9ULW8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PADI3Q9ULW8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PADI3Q9ULW8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PADI3Q9ULW8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PADI3Q9ULW8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PADI3Q9ULW8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PADI3Q9ULW8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PADI3Q9ULW8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PADI3Q9ULW8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PADI3Q9ULW8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PADI3Q9ULW8 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PADI3Q9ULW8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PADI3Q9ULW8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PADI3Q9ULW8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PADI3Q9ULW8 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PADI3Q9ULW8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PADI3Q9ULW8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PADI3Q9ULW8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PADI3Q9ULW8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PADI3Q9ULW8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PADI3Q9ULW8 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PADI3Q9ULW8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PADI3Q9ULW8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PADI3Q9ULW8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
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