Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULM6

CNOT6, CCR4-NOT transcription complex subunit 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT6Q9ULM6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CNOT6Q9ULM6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNOT6Q9ULM6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNOT6Q9ULM6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNOT6Q9ULM6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNOT6Q9ULM6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNOT6Q9ULM6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNOT6Q9ULM6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNOT6Q9ULM6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CNOT6Q9ULM6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNOT6Q9ULM6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CNOT6Q9ULM6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CNOT6Q9ULM6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CNOT6Q9ULM6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNOT6Q9ULM6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNOT6Q9ULM6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNOT6Q9ULM6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNOT6Q9ULM6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNOT6Q9ULM6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNOT6Q9ULM6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNOT6Q9ULM6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNOT6Q9ULM6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNOT6Q9ULM6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNOT6Q9ULM6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNOT6Q9ULM6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNOT6Q9ULM6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNOT6Q9ULM6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CNOT6Q9ULM6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNOT6Q9ULM6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNOT6Q9ULM6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNOT6Q9ULM6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNOT6Q9ULM6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNOT6Q9ULM6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNOT6Q9ULM6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNOT6Q9ULM6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNOT6Q9ULM6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNOT6Q9ULM6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNOT6Q9ULM6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNOT6Q9ULM6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNOT6Q9ULM6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNOT6Q9ULM6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNOT6Q9ULM6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNOT6Q9ULM6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNOT6Q9ULM6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNOT6Q9ULM6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNOT6Q9ULM6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNOT6Q9ULM6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNOT6Q9ULM6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNOT6Q9ULM6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNOT6Q9ULM6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNOT6Q9ULM6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNOT6Q9ULM6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNOT6Q9ULM6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNOT6Q9ULM6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNOT6Q9ULM6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNOT6Q9ULM6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNOT6Q9ULM6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNOT6Q9ULM6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNOT6Q9ULM6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNOT6Q9ULM6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNOT6Q9ULM6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNOT6Q9ULM6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNOT6Q9ULM6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNOT6Q9ULM6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNOT6Q9ULM6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNOT6Q9ULM6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CNOT6Q9ULM6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNOT6Q9ULM6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNOT6Q9ULM6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNOT6Q9ULM6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNOT6Q9ULM6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNOT6Q9ULM6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNOT6Q9ULM6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNOT6Q9ULM6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CNOT6Q9ULM6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNOT6Q9ULM6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CNOT6Q9ULM6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNOT6Q9ULM6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNOT6Q9ULM6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNOT6Q9ULM6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CNOT6Q9ULM6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNOT6Q9ULM6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNOT6Q9ULM6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNOT6Q9ULM6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNOT6Q9ULM6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNOT6Q9ULM6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CNOT6Q9ULM6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CNOT6Q9ULM6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CNOT6Q9ULM6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CNOT6Q9ULM6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNOT6Q9ULM6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNOT6Q9ULM6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNOT6Q9ULM6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNOT6Q9ULM6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNOT6Q9ULM6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNOT6Q9ULM6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNOT6Q9ULM6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNOT6Q9ULM6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNOT6Q9ULM6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNOT6Q9ULM6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms