Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULH4

LRFN2, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRFN2Q9ULH4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRFN2Q9ULH4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRFN2Q9ULH4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRFN2Q9ULH4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRFN2Q9ULH4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRFN2Q9ULH4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRFN2Q9ULH4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
LRFN2Q9ULH4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRFN2Q9ULH4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRFN2Q9ULH4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRFN2Q9ULH4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
LRFN2Q9ULH4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRFN2Q9ULH4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRFN2Q9ULH4 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRFN2Q9ULH4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRFN2Q9ULH4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRFN2Q9ULH4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRFN2Q9ULH4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRFN2Q9ULH4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRFN2Q9ULH4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
LRFN2Q9ULH4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
LRFN2Q9ULH4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRFN2Q9ULH4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRFN2Q9ULH4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRFN2Q9ULH4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRFN2Q9ULH4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRFN2Q9ULH4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRFN2Q9ULH4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRFN2Q9ULH4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRFN2Q9ULH4 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
LRFN2Q9ULH4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
LRFN2Q9ULH4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRFN2Q9ULH4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRFN2Q9ULH4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRFN2Q9ULH4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRFN2Q9ULH4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRFN2Q9ULH4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRFN2Q9ULH4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRFN2Q9ULH4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRFN2Q9ULH4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRFN2Q9ULH4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRFN2Q9ULH4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRFN2Q9ULH4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRFN2Q9ULH4 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRFN2Q9ULH4 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRFN2Q9ULH4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRFN2Q9ULH4 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRFN2Q9ULH4 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRFN2Q9ULH4 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRFN2Q9ULH4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRFN2Q9ULH4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRFN2Q9ULH4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRFN2Q9ULH4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRFN2Q9ULH4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRFN2Q9ULH4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRFN2Q9ULH4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRFN2Q9ULH4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRFN2Q9ULH4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRFN2Q9ULH4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRFN2Q9ULH4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRFN2Q9ULH4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
LRFN2Q9ULH4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRFN2Q9ULH4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRFN2Q9ULH4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRFN2Q9ULH4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRFN2Q9ULH4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRFN2Q9ULH4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRFN2Q9ULH4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRFN2Q9ULH4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRFN2Q9ULH4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRFN2Q9ULH4 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRFN2Q9ULH4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRFN2Q9ULH4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRFN2Q9ULH4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRFN2Q9ULH4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRFN2Q9ULH4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRFN2Q9ULH4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LRFN2Q9ULH4 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25■■□□□ 1.59
LRFN2Q9ULH4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25■■□□□ 1.59
LRFN2Q9ULH4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRFN2Q9ULH4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRFN2Q9ULH4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRFN2Q9ULH4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRFN2Q9ULH4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRFN2Q9ULH4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LRFN2Q9ULH4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRFN2Q9ULH4 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRFN2Q9ULH4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRFN2Q9ULH4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRFN2Q9ULH4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRFN2Q9ULH4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
LRFN2Q9ULH4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRFN2Q9ULH4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
LRFN2Q9ULH4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRFN2Q9ULH4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRFN2Q9ULH4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRFN2Q9ULH4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
LRFN2Q9ULH4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRFN2Q9ULH4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRFN2Q9ULH4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms