Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY5

GGA1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA1Q9UJY5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GGA1Q9UJY5 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
GGA1Q9UJY5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
GGA1Q9UJY5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GGA1Q9UJY5 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GGA1Q9UJY5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GGA1Q9UJY5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GGA1Q9UJY5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GGA1Q9UJY5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GGA1Q9UJY5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GGA1Q9UJY5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GGA1Q9UJY5 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GGA1Q9UJY5 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GGA1Q9UJY5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GGA1Q9UJY5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
GGA1Q9UJY5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GGA1Q9UJY5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GGA1Q9UJY5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GGA1Q9UJY5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GGA1Q9UJY5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GGA1Q9UJY5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GGA1Q9UJY5 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GGA1Q9UJY5 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
GGA1Q9UJY5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GGA1Q9UJY5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GGA1Q9UJY5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GGA1Q9UJY5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
GGA1Q9UJY5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GGA1Q9UJY5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GGA1Q9UJY5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GGA1Q9UJY5 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GGA1Q9UJY5 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GGA1Q9UJY5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GGA1Q9UJY5 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GGA1Q9UJY5 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GGA1Q9UJY5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GGA1Q9UJY5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GGA1Q9UJY5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GGA1Q9UJY5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GGA1Q9UJY5 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GGA1Q9UJY5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GGA1Q9UJY5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GGA1Q9UJY5 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
GGA1Q9UJY5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GGA1Q9UJY5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GGA1Q9UJY5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GGA1Q9UJY5 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GGA1Q9UJY5 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GGA1Q9UJY5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GGA1Q9UJY5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GGA1Q9UJY5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GGA1Q9UJY5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GGA1Q9UJY5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GGA1Q9UJY5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GGA1Q9UJY5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GGA1Q9UJY5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GGA1Q9UJY5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
GGA1Q9UJY5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GGA1Q9UJY5 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GGA1Q9UJY5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GGA1Q9UJY5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GGA1Q9UJY5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GGA1Q9UJY5 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GGA1Q9UJY5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GGA1Q9UJY5 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
GGA1Q9UJY5 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GGA1Q9UJY5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GGA1Q9UJY5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GGA1Q9UJY5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GGA1Q9UJY5 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GGA1Q9UJY5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GGA1Q9UJY5 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GGA1Q9UJY5 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
GGA1Q9UJY5 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GGA1Q9UJY5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GGA1Q9UJY5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GGA1Q9UJY5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GGA1Q9UJY5 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GGA1Q9UJY5 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
GGA1Q9UJY5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GGA1Q9UJY5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GGA1Q9UJY5 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GGA1Q9UJY5 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
GGA1Q9UJY5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GGA1Q9UJY5 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GGA1Q9UJY5 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
GGA1Q9UJY5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GGA1Q9UJY5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GGA1Q9UJY5 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GGA1Q9UJY5 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GGA1Q9UJY5 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GGA1Q9UJY5 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
GGA1Q9UJY5 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GGA1Q9UJY5 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
GGA1Q9UJY5 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GGA1Q9UJY5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GGA1Q9UJY5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GGA1Q9UJY5 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GGA1Q9UJY5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
GGA1Q9UJY5 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms