Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJX2

CDC23, Cell division cycle protein 23 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC23Q9UJX2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDC23Q9UJX2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDC23Q9UJX2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDC23Q9UJX2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDC23Q9UJX2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDC23Q9UJX2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDC23Q9UJX2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDC23Q9UJX2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDC23Q9UJX2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDC23Q9UJX2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDC23Q9UJX2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDC23Q9UJX2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CDC23Q9UJX2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDC23Q9UJX2 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDC23Q9UJX2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDC23Q9UJX2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDC23Q9UJX2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDC23Q9UJX2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDC23Q9UJX2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDC23Q9UJX2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDC23Q9UJX2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDC23Q9UJX2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDC23Q9UJX2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDC23Q9UJX2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDC23Q9UJX2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDC23Q9UJX2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDC23Q9UJX2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDC23Q9UJX2 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDC23Q9UJX2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDC23Q9UJX2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDC23Q9UJX2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CDC23Q9UJX2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDC23Q9UJX2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDC23Q9UJX2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CDC23Q9UJX2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDC23Q9UJX2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDC23Q9UJX2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CDC23Q9UJX2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDC23Q9UJX2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDC23Q9UJX2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDC23Q9UJX2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDC23Q9UJX2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDC23Q9UJX2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDC23Q9UJX2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CDC23Q9UJX2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDC23Q9UJX2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDC23Q9UJX2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDC23Q9UJX2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDC23Q9UJX2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDC23Q9UJX2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDC23Q9UJX2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDC23Q9UJX2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDC23Q9UJX2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CDC23Q9UJX2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CDC23Q9UJX2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CDC23Q9UJX2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
CDC23Q9UJX2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDC23Q9UJX2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CDC23Q9UJX2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDC23Q9UJX2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDC23Q9UJX2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDC23Q9UJX2 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDC23Q9UJX2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDC23Q9UJX2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDC23Q9UJX2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDC23Q9UJX2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDC23Q9UJX2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDC23Q9UJX2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDC23Q9UJX2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDC23Q9UJX2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDC23Q9UJX2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDC23Q9UJX2 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDC23Q9UJX2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDC23Q9UJX2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDC23Q9UJX2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDC23Q9UJX2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDC23Q9UJX2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDC23Q9UJX2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDC23Q9UJX2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDC23Q9UJX2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDC23Q9UJX2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDC23Q9UJX2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDC23Q9UJX2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDC23Q9UJX2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDC23Q9UJX2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDC23Q9UJX2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDC23Q9UJX2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDC23Q9UJX2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDC23Q9UJX2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDC23Q9UJX2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDC23Q9UJX2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDC23Q9UJX2 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDC23Q9UJX2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDC23Q9UJX2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDC23Q9UJX2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDC23Q9UJX2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDC23Q9UJX2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDC23Q9UJX2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDC23Q9UJX2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDC23Q9UJX2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1275.7 ms