Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJW3

DNMT3L, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3-like, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3LQ9UJW3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DNMT3LQ9UJW3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DNMT3LQ9UJW3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DNMT3LQ9UJW3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DNMT3LQ9UJW3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DNMT3LQ9UJW3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DNMT3LQ9UJW3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DNMT3LQ9UJW3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DNMT3LQ9UJW3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
DNMT3LQ9UJW3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DNMT3LQ9UJW3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DNMT3LQ9UJW3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DNMT3LQ9UJW3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DNMT3LQ9UJW3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DNMT3LQ9UJW3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DNMT3LQ9UJW3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DNMT3LQ9UJW3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DNMT3LQ9UJW3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
DNMT3LQ9UJW3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DNMT3LQ9UJW3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DNMT3LQ9UJW3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DNMT3LQ9UJW3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DNMT3LQ9UJW3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DNMT3LQ9UJW3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DNMT3LQ9UJW3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DNMT3LQ9UJW3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DNMT3LQ9UJW3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DNMT3LQ9UJW3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
DNMT3LQ9UJW3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
DNMT3LQ9UJW3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DNMT3LQ9UJW3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DNMT3LQ9UJW3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DNMT3LQ9UJW3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DNMT3LQ9UJW3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DNMT3LQ9UJW3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DNMT3LQ9UJW3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DNMT3LQ9UJW3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNMT3LQ9UJW3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNMT3LQ9UJW3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNMT3LQ9UJW3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNMT3LQ9UJW3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNMT3LQ9UJW3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNMT3LQ9UJW3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNMT3LQ9UJW3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
DNMT3LQ9UJW3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNMT3LQ9UJW3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
DNMT3LQ9UJW3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNMT3LQ9UJW3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNMT3LQ9UJW3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DNMT3LQ9UJW3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DNMT3LQ9UJW3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DNMT3LQ9UJW3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DNMT3LQ9UJW3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DNMT3LQ9UJW3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
DNMT3LQ9UJW3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DNMT3LQ9UJW3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DNMT3LQ9UJW3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DNMT3LQ9UJW3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DNMT3LQ9UJW3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DNMT3LQ9UJW3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
DNMT3LQ9UJW3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
DNMT3LQ9UJW3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
DNMT3LQ9UJW3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DNMT3LQ9UJW3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24■■□□□ 1.43
DNMT3LQ9UJW3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
DNMT3LQ9UJW3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DNMT3LQ9UJW3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNMT3LQ9UJW3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNMT3LQ9UJW3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNMT3LQ9UJW3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNMT3LQ9UJW3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNMT3LQ9UJW3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNMT3LQ9UJW3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNMT3LQ9UJW3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNMT3LQ9UJW3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNMT3LQ9UJW3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNMT3LQ9UJW3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNMT3LQ9UJW3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNMT3LQ9UJW3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DNMT3LQ9UJW3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DNMT3LQ9UJW3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DNMT3LQ9UJW3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DNMT3LQ9UJW3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
DNMT3LQ9UJW3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DNMT3LQ9UJW3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DNMT3LQ9UJW3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DNMT3LQ9UJW3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DNMT3LQ9UJW3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DNMT3LQ9UJW3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DNMT3LQ9UJW3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DNMT3LQ9UJW3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DNMT3LQ9UJW3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DNMT3LQ9UJW3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DNMT3LQ9UJW3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DNMT3LQ9UJW3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DNMT3LQ9UJW3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DNMT3LQ9UJW3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DNMT3LQ9UJW3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DNMT3LQ9UJW3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
DNMT3LQ9UJW3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms