Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJV3

MID2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MID2Q9UJV3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MID2Q9UJV3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MID2Q9UJV3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MID2Q9UJV3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MID2Q9UJV3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MID2Q9UJV3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MID2Q9UJV3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MID2Q9UJV3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MID2Q9UJV3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MID2Q9UJV3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MID2Q9UJV3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MID2Q9UJV3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MID2Q9UJV3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MID2Q9UJV3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MID2Q9UJV3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MID2Q9UJV3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MID2Q9UJV3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MID2Q9UJV3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MID2Q9UJV3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MID2Q9UJV3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MID2Q9UJV3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MID2Q9UJV3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MID2Q9UJV3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MID2Q9UJV3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MID2Q9UJV3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MID2Q9UJV3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MID2Q9UJV3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MID2Q9UJV3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MID2Q9UJV3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MID2Q9UJV3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MID2Q9UJV3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MID2Q9UJV3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MID2Q9UJV3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MID2Q9UJV3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MID2Q9UJV3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
MID2Q9UJV3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MID2Q9UJV3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MID2Q9UJV3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MID2Q9UJV3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MID2Q9UJV3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MID2Q9UJV3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MID2Q9UJV3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MID2Q9UJV3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MID2Q9UJV3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MID2Q9UJV3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MID2Q9UJV3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MID2Q9UJV3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MID2Q9UJV3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MID2Q9UJV3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MID2Q9UJV3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MID2Q9UJV3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MID2Q9UJV3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MID2Q9UJV3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MID2Q9UJV3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MID2Q9UJV3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MID2Q9UJV3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MID2Q9UJV3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MID2Q9UJV3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MID2Q9UJV3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MID2Q9UJV3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MID2Q9UJV3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MID2Q9UJV3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MID2Q9UJV3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MID2Q9UJV3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MID2Q9UJV3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MID2Q9UJV3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MID2Q9UJV3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MID2Q9UJV3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MID2Q9UJV3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MID2Q9UJV3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MID2Q9UJV3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MID2Q9UJV3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MID2Q9UJV3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MID2Q9UJV3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MID2Q9UJV3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MID2Q9UJV3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MID2Q9UJV3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MID2Q9UJV3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MID2Q9UJV3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MID2Q9UJV3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MID2Q9UJV3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MID2Q9UJV3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MID2Q9UJV3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MID2Q9UJV3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MID2Q9UJV3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MID2Q9UJV3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MID2Q9UJV3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MID2Q9UJV3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MID2Q9UJV3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MID2Q9UJV3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MID2Q9UJV3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MID2Q9UJV3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MID2Q9UJV3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MID2Q9UJV3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MID2Q9UJV3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MID2Q9UJV3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MID2Q9UJV3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MID2Q9UJV3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MID2Q9UJV3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MID2Q9UJV3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms