Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ68

MSRA, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRAQ9UJ68 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MSRAQ9UJ68 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MSRAQ9UJ68 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MSRAQ9UJ68 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MSRAQ9UJ68 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MSRAQ9UJ68 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MSRAQ9UJ68 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MSRAQ9UJ68 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MSRAQ9UJ68 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MSRAQ9UJ68 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MSRAQ9UJ68 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MSRAQ9UJ68 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
MSRAQ9UJ68 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MSRAQ9UJ68 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MSRAQ9UJ68 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MSRAQ9UJ68 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MSRAQ9UJ68 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MSRAQ9UJ68 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MSRAQ9UJ68 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MSRAQ9UJ68 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
MSRAQ9UJ68 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MSRAQ9UJ68 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MSRAQ9UJ68 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MSRAQ9UJ68 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MSRAQ9UJ68 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MSRAQ9UJ68 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MSRAQ9UJ68 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MSRAQ9UJ68 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MSRAQ9UJ68 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MSRAQ9UJ68 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MSRAQ9UJ68 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
MSRAQ9UJ68 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
MSRAQ9UJ68 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MSRAQ9UJ68 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MSRAQ9UJ68 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MSRAQ9UJ68 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MSRAQ9UJ68 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MSRAQ9UJ68 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MSRAQ9UJ68 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MSRAQ9UJ68 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MSRAQ9UJ68 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MSRAQ9UJ68 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MSRAQ9UJ68 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MSRAQ9UJ68 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MSRAQ9UJ68 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
MSRAQ9UJ68 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MSRAQ9UJ68 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
MSRAQ9UJ68 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
MSRAQ9UJ68 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
MSRAQ9UJ68 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MSRAQ9UJ68 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MSRAQ9UJ68 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MSRAQ9UJ68 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MSRAQ9UJ68 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MSRAQ9UJ68 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MSRAQ9UJ68 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MSRAQ9UJ68 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MSRAQ9UJ68 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MSRAQ9UJ68 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MSRAQ9UJ68 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MSRAQ9UJ68 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MSRAQ9UJ68 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MSRAQ9UJ68 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MSRAQ9UJ68 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
MSRAQ9UJ68 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
MSRAQ9UJ68 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
MSRAQ9UJ68 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MSRAQ9UJ68 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MSRAQ9UJ68 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MSRAQ9UJ68 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MSRAQ9UJ68 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MSRAQ9UJ68 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MSRAQ9UJ68 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MSRAQ9UJ68 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MSRAQ9UJ68 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MSRAQ9UJ68 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MSRAQ9UJ68 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MSRAQ9UJ68 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MSRAQ9UJ68 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MSRAQ9UJ68 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MSRAQ9UJ68 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MSRAQ9UJ68 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MSRAQ9UJ68 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MSRAQ9UJ68 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MSRAQ9UJ68 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MSRAQ9UJ68 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MSRAQ9UJ68 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MSRAQ9UJ68 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MSRAQ9UJ68 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MSRAQ9UJ68 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
MSRAQ9UJ68 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MSRAQ9UJ68 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MSRAQ9UJ68 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MSRAQ9UJ68 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MSRAQ9UJ68 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MSRAQ9UJ68 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
MSRAQ9UJ68 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MSRAQ9UJ68 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MSRAQ9UJ68 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
MSRAQ9UJ68 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms