Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIK5

TMEFF2, Tomoregulin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEFF2Q9UIK5 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TMEFF2Q9UIK5 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TMEFF2Q9UIK5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TMEFF2Q9UIK5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TMEFF2Q9UIK5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEFF2Q9UIK5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEFF2Q9UIK5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEFF2Q9UIK5 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEFF2Q9UIK5 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEFF2Q9UIK5 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEFF2Q9UIK5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEFF2Q9UIK5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEFF2Q9UIK5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEFF2Q9UIK5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TMEFF2Q9UIK5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEFF2Q9UIK5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEFF2Q9UIK5 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEFF2Q9UIK5 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEFF2Q9UIK5 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEFF2Q9UIK5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEFF2Q9UIK5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEFF2Q9UIK5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEFF2Q9UIK5 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEFF2Q9UIK5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEFF2Q9UIK5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEFF2Q9UIK5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TMEFF2Q9UIK5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEFF2Q9UIK5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEFF2Q9UIK5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEFF2Q9UIK5 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEFF2Q9UIK5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEFF2Q9UIK5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEFF2Q9UIK5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TMEFF2Q9UIK5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEFF2Q9UIK5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEFF2Q9UIK5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEFF2Q9UIK5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEFF2Q9UIK5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEFF2Q9UIK5 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TMEFF2Q9UIK5 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEFF2Q9UIK5 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEFF2Q9UIK5 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEFF2Q9UIK5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEFF2Q9UIK5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEFF2Q9UIK5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEFF2Q9UIK5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEFF2Q9UIK5 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEFF2Q9UIK5 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEFF2Q9UIK5 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEFF2Q9UIK5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TMEFF2Q9UIK5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEFF2Q9UIK5 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEFF2Q9UIK5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEFF2Q9UIK5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEFF2Q9UIK5 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEFF2Q9UIK5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEFF2Q9UIK5 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEFF2Q9UIK5 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEFF2Q9UIK5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEFF2Q9UIK5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEFF2Q9UIK5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TMEFF2Q9UIK5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEFF2Q9UIK5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEFF2Q9UIK5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEFF2Q9UIK5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
TMEFF2Q9UIK5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TMEFF2Q9UIK5 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEFF2Q9UIK5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEFF2Q9UIK5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEFF2Q9UIK5 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEFF2Q9UIK5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEFF2Q9UIK5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEFF2Q9UIK5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEFF2Q9UIK5 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEFF2Q9UIK5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEFF2Q9UIK5 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEFF2Q9UIK5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEFF2Q9UIK5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEFF2Q9UIK5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEFF2Q9UIK5 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEFF2Q9UIK5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEFF2Q9UIK5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEFF2Q9UIK5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEFF2Q9UIK5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEFF2Q9UIK5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEFF2Q9UIK5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEFF2Q9UIK5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEFF2Q9UIK5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEFF2Q9UIK5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEFF2Q9UIK5 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEFF2Q9UIK5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEFF2Q9UIK5 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEFF2Q9UIK5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEFF2Q9UIK5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEFF2Q9UIK5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEFF2Q9UIK5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEFF2Q9UIK5 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEFF2Q9UIK5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEFF2Q9UIK5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEFF2Q9UIK5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.9 ms