Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH64

CDKN2A-AS1, Susceptibility protein NSG-x, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2A-AS1Q9UH64 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDKN2A-AS1Q9UH64 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDKN2A-AS1Q9UH64 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDKN2A-AS1Q9UH64 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDKN2A-AS1Q9UH64 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKN2A-AS1Q9UH64 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKN2A-AS1Q9UH64 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKN2A-AS1Q9UH64 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKN2A-AS1Q9UH64 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKN2A-AS1Q9UH64 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKN2A-AS1Q9UH64 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKN2A-AS1Q9UH64 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKN2A-AS1Q9UH64 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKN2A-AS1Q9UH64 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKN2A-AS1Q9UH64 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKN2A-AS1Q9UH64 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKN2A-AS1Q9UH64 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKN2A-AS1Q9UH64 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKN2A-AS1Q9UH64 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKN2A-AS1Q9UH64 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKN2A-AS1Q9UH64 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKN2A-AS1Q9UH64 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKN2A-AS1Q9UH64 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKN2A-AS1Q9UH64 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDKN2A-AS1Q9UH64 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDKN2A-AS1Q9UH64 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDKN2A-AS1Q9UH64 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDKN2A-AS1Q9UH64 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDKN2A-AS1Q9UH64 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDKN2A-AS1Q9UH64 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDKN2A-AS1Q9UH64 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDKN2A-AS1Q9UH64 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDKN2A-AS1Q9UH64 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDKN2A-AS1Q9UH64 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKN2A-AS1Q9UH64 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKN2A-AS1Q9UH64 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKN2A-AS1Q9UH64 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKN2A-AS1Q9UH64 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKN2A-AS1Q9UH64 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKN2A-AS1Q9UH64 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKN2A-AS1Q9UH64 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKN2A-AS1Q9UH64 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKN2A-AS1Q9UH64 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKN2A-AS1Q9UH64 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKN2A-AS1Q9UH64 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKN2A-AS1Q9UH64 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKN2A-AS1Q9UH64 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKN2A-AS1Q9UH64 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKN2A-AS1Q9UH64 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKN2A-AS1Q9UH64 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKN2A-AS1Q9UH64 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKN2A-AS1Q9UH64 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKN2A-AS1Q9UH64 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKN2A-AS1Q9UH64 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKN2A-AS1Q9UH64 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKN2A-AS1Q9UH64 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKN2A-AS1Q9UH64 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKN2A-AS1Q9UH64 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKN2A-AS1Q9UH64 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKN2A-AS1Q9UH64 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKN2A-AS1Q9UH64 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKN2A-AS1Q9UH64 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKN2A-AS1Q9UH64 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKN2A-AS1Q9UH64 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDKN2A-AS1Q9UH64 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDKN2A-AS1Q9UH64 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDKN2A-AS1Q9UH64 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDKN2A-AS1Q9UH64 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDKN2A-AS1Q9UH64 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDKN2A-AS1Q9UH64 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDKN2A-AS1Q9UH64 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDKN2A-AS1Q9UH64 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDKN2A-AS1Q9UH64 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDKN2A-AS1Q9UH64 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDKN2A-AS1Q9UH64 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDKN2A-AS1Q9UH64 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDKN2A-AS1Q9UH64 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDKN2A-AS1Q9UH64 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDKN2A-AS1Q9UH64 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKN2A-AS1Q9UH64 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKN2A-AS1Q9UH64 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKN2A-AS1Q9UH64 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKN2A-AS1Q9UH64 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKN2A-AS1Q9UH64 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKN2A-AS1Q9UH64 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKN2A-AS1Q9UH64 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKN2A-AS1Q9UH64 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKN2A-AS1Q9UH64 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKN2A-AS1Q9UH64 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKN2A-AS1Q9UH64 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKN2A-AS1Q9UH64 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDKN2A-AS1Q9UH64 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDKN2A-AS1Q9UH64 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDKN2A-AS1Q9UH64 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDKN2A-AS1Q9UH64 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDKN2A-AS1Q9UH64 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDKN2A-AS1Q9UH64 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDKN2A-AS1Q9UH64 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDKN2A-AS1Q9UH64 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDKN2A-AS1Q9UH64 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms