Protein–RNA interactions for Protein: Q9UF33

EPHA6, Ephrin type-A receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA6Q9UF33 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EPHA6Q9UF33 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EPHA6Q9UF33 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EPHA6Q9UF33 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EPHA6Q9UF33 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EPHA6Q9UF33 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EPHA6Q9UF33 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EPHA6Q9UF33 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EPHA6Q9UF33 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EPHA6Q9UF33 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EPHA6Q9UF33 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EPHA6Q9UF33 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EPHA6Q9UF33 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EPHA6Q9UF33 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EPHA6Q9UF33 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EPHA6Q9UF33 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EPHA6Q9UF33 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EPHA6Q9UF33 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EPHA6Q9UF33 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPHA6Q9UF33 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
EPHA6Q9UF33 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPHA6Q9UF33 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPHA6Q9UF33 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPHA6Q9UF33 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPHA6Q9UF33 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
EPHA6Q9UF33 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPHA6Q9UF33 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPHA6Q9UF33 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPHA6Q9UF33 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPHA6Q9UF33 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPHA6Q9UF33 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPHA6Q9UF33 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPHA6Q9UF33 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPHA6Q9UF33 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPHA6Q9UF33 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPHA6Q9UF33 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPHA6Q9UF33 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPHA6Q9UF33 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPHA6Q9UF33 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPHA6Q9UF33 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPHA6Q9UF33 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
EPHA6Q9UF33 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EPHA6Q9UF33 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EPHA6Q9UF33 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EPHA6Q9UF33 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EPHA6Q9UF33 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EPHA6Q9UF33 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EPHA6Q9UF33 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EPHA6Q9UF33 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EPHA6Q9UF33 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EPHA6Q9UF33 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EPHA6Q9UF33 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EPHA6Q9UF33 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPHA6Q9UF33 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPHA6Q9UF33 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPHA6Q9UF33 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
EPHA6Q9UF33 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPHA6Q9UF33 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
EPHA6Q9UF33 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPHA6Q9UF33 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPHA6Q9UF33 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPHA6Q9UF33 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPHA6Q9UF33 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPHA6Q9UF33 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPHA6Q9UF33 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
EPHA6Q9UF33 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPHA6Q9UF33 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPHA6Q9UF33 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPHA6Q9UF33 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPHA6Q9UF33 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPHA6Q9UF33 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
EPHA6Q9UF33 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPHA6Q9UF33 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPHA6Q9UF33 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPHA6Q9UF33 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPHA6Q9UF33 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPHA6Q9UF33 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPHA6Q9UF33 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPHA6Q9UF33 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPHA6Q9UF33 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPHA6Q9UF33 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
EPHA6Q9UF33 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPHA6Q9UF33 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPHA6Q9UF33 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPHA6Q9UF33 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPHA6Q9UF33 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPHA6Q9UF33 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPHA6Q9UF33 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPHA6Q9UF33 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPHA6Q9UF33 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPHA6Q9UF33 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPHA6Q9UF33 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPHA6Q9UF33 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPHA6Q9UF33 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPHA6Q9UF33 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPHA6Q9UF33 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPHA6Q9UF33 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPHA6Q9UF33 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPHA6Q9UF33 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPHA6Q9UF33 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms