Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HCN3Q9P1Z3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HCN3Q9P1Z3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HCN3Q9P1Z3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HCN3Q9P1Z3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HCN3Q9P1Z3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HCN3Q9P1Z3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HCN3Q9P1Z3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HCN3Q9P1Z3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HCN3Q9P1Z3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HCN3Q9P1Z3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HCN3Q9P1Z3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HCN3Q9P1Z3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HCN3Q9P1Z3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HCN3Q9P1Z3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HCN3Q9P1Z3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HCN3Q9P1Z3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HCN3Q9P1Z3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HCN3Q9P1Z3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HCN3Q9P1Z3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HCN3Q9P1Z3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HCN3Q9P1Z3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HCN3Q9P1Z3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
HCN3Q9P1Z3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HCN3Q9P1Z3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
HCN3Q9P1Z3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HCN3Q9P1Z3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HCN3Q9P1Z3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HCN3Q9P1Z3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HCN3Q9P1Z3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
HCN3Q9P1Z3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HCN3Q9P1Z3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HCN3Q9P1Z3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HCN3Q9P1Z3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HCN3Q9P1Z3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HCN3Q9P1Z3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HCN3Q9P1Z3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HCN3Q9P1Z3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
HCN3Q9P1Z3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HCN3Q9P1Z3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HCN3Q9P1Z3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HCN3Q9P1Z3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HCN3Q9P1Z3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HCN3Q9P1Z3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HCN3Q9P1Z3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HCN3Q9P1Z3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HCN3Q9P1Z3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HCN3Q9P1Z3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HCN3Q9P1Z3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HCN3Q9P1Z3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HCN3Q9P1Z3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HCN3Q9P1Z3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HCN3Q9P1Z3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HCN3Q9P1Z3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HCN3Q9P1Z3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HCN3Q9P1Z3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HCN3Q9P1Z3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HCN3Q9P1Z3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HCN3Q9P1Z3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HCN3Q9P1Z3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HCN3Q9P1Z3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HCN3Q9P1Z3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HCN3Q9P1Z3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HCN3Q9P1Z3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HCN3Q9P1Z3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HCN3Q9P1Z3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
HCN3Q9P1Z3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HCN3Q9P1Z3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HCN3Q9P1Z3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HCN3Q9P1Z3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HCN3Q9P1Z3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HCN3Q9P1Z3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HCN3Q9P1Z3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HCN3Q9P1Z3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HCN3Q9P1Z3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
HCN3Q9P1Z3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HCN3Q9P1Z3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HCN3Q9P1Z3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HCN3Q9P1Z3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HCN3Q9P1Z3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HCN3Q9P1Z3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HCN3Q9P1Z3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HCN3Q9P1Z3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HCN3Q9P1Z3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HCN3Q9P1Z3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HCN3Q9P1Z3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HCN3Q9P1Z3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HCN3Q9P1Z3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HCN3Q9P1Z3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HCN3Q9P1Z3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HCN3Q9P1Z3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HCN3Q9P1Z3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HCN3Q9P1Z3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HCN3Q9P1Z3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HCN3Q9P1Z3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HCN3Q9P1Z3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HCN3Q9P1Z3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HCN3Q9P1Z3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HCN3Q9P1Z3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
HCN3Q9P1Z3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms