Protein–RNA interactions for Protein: Q9P031

CCDC59, Thyroid transcription factor 1-associated protein 26, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC59Q9P031 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC59Q9P031 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC59Q9P031 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC59Q9P031 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC59Q9P031 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC59Q9P031 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC59Q9P031 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC59Q9P031 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC59Q9P031 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC59Q9P031 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC59Q9P031 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC59Q9P031 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC59Q9P031 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC59Q9P031 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC59Q9P031 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC59Q9P031 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC59Q9P031 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC59Q9P031 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC59Q9P031 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC59Q9P031 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC59Q9P031 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC59Q9P031 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC59Q9P031 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC59Q9P031 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC59Q9P031 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC59Q9P031 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC59Q9P031 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC59Q9P031 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC59Q9P031 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC59Q9P031 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC59Q9P031 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC59Q9P031 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC59Q9P031 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC59Q9P031 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC59Q9P031 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC59Q9P031 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC59Q9P031 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC59Q9P031 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC59Q9P031 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC59Q9P031 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC59Q9P031 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC59Q9P031 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC59Q9P031 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC59Q9P031 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC59Q9P031 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC59Q9P031 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC59Q9P031 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC59Q9P031 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC59Q9P031 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC59Q9P031 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC59Q9P031 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC59Q9P031 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC59Q9P031 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC59Q9P031 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC59Q9P031 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC59Q9P031 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC59Q9P031 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC59Q9P031 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC59Q9P031 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC59Q9P031 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC59Q9P031 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC59Q9P031 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC59Q9P031 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC59Q9P031 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC59Q9P031 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC59Q9P031 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC59Q9P031 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC59Q9P031 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC59Q9P031 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC59Q9P031 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC59Q9P031 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC59Q9P031 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC59Q9P031 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC59Q9P031 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC59Q9P031 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC59Q9P031 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC59Q9P031 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC59Q9P031 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC59Q9P031 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC59Q9P031 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC59Q9P031 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC59Q9P031 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC59Q9P031 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC59Q9P031 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC59Q9P031 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC59Q9P031 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC59Q9P031 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC59Q9P031 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC59Q9P031 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC59Q9P031 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC59Q9P031 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC59Q9P031 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC59Q9P031 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC59Q9P031 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC59Q9P031 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC59Q9P031 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC59Q9P031 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC59Q9P031 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC59Q9P031 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC59Q9P031 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms