Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZQ9

TMOD4, Tropomodulin-4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD4Q9NZQ9 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMOD4Q9NZQ9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMOD4Q9NZQ9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMOD4Q9NZQ9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMOD4Q9NZQ9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMOD4Q9NZQ9 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TMOD4Q9NZQ9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMOD4Q9NZQ9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMOD4Q9NZQ9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMOD4Q9NZQ9 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TMOD4Q9NZQ9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
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TMOD4Q9NZQ9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TMOD4Q9NZQ9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TMOD4Q9NZQ9 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TMOD4Q9NZQ9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TMOD4Q9NZQ9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
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TMOD4Q9NZQ9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TMOD4Q9NZQ9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
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TMOD4Q9NZQ9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMOD4Q9NZQ9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMOD4Q9NZQ9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMOD4Q9NZQ9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMOD4Q9NZQ9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMOD4Q9NZQ9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMOD4Q9NZQ9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMOD4Q9NZQ9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMOD4Q9NZQ9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMOD4Q9NZQ9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMOD4Q9NZQ9 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMOD4Q9NZQ9 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMOD4Q9NZQ9 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMOD4Q9NZQ9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMOD4Q9NZQ9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMOD4Q9NZQ9 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMOD4Q9NZQ9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
TMOD4Q9NZQ9 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMOD4Q9NZQ9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMOD4Q9NZQ9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMOD4Q9NZQ9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMOD4Q9NZQ9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
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TMOD4Q9NZQ9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMOD4Q9NZQ9 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMOD4Q9NZQ9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
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TMOD4Q9NZQ9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
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TMOD4Q9NZQ9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMOD4Q9NZQ9 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
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TMOD4Q9NZQ9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMOD4Q9NZQ9 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMOD4Q9NZQ9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMOD4Q9NZQ9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
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TMOD4Q9NZQ9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMOD4Q9NZQ9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMOD4Q9NZQ9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMOD4Q9NZQ9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMOD4Q9NZQ9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMOD4Q9NZQ9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMOD4Q9NZQ9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMOD4Q9NZQ9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMOD4Q9NZQ9 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMOD4Q9NZQ9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMOD4Q9NZQ9 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMOD4Q9NZQ9 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
TMOD4Q9NZQ9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMOD4Q9NZQ9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TMOD4Q9NZQ9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMOD4Q9NZQ9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMOD4Q9NZQ9 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMOD4Q9NZQ9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMOD4Q9NZQ9 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMOD4Q9NZQ9 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMOD4Q9NZQ9 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
TMOD4Q9NZQ9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMOD4Q9NZQ9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMOD4Q9NZQ9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMOD4Q9NZQ9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMOD4Q9NZQ9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMOD4Q9NZQ9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMOD4Q9NZQ9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMOD4Q9NZQ9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMOD4Q9NZQ9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
TMOD4Q9NZQ9 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMOD4Q9NZQ9 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMOD4Q9NZQ9 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMOD4Q9NZQ9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
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