Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
GDE1Q9NZC3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GDE1Q9NZC3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GDE1Q9NZC3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GDE1Q9NZC3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GDE1Q9NZC3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GDE1Q9NZC3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GDE1Q9NZC3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GDE1Q9NZC3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GDE1Q9NZC3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GDE1Q9NZC3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
GDE1Q9NZC3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GDE1Q9NZC3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GDE1Q9NZC3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GDE1Q9NZC3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GDE1Q9NZC3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
GDE1Q9NZC3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GDE1Q9NZC3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GDE1Q9NZC3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GDE1Q9NZC3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GDE1Q9NZC3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GDE1Q9NZC3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24■■□□□ 1.43
GDE1Q9NZC3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GDE1Q9NZC3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GDE1Q9NZC3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GDE1Q9NZC3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GDE1Q9NZC3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GDE1Q9NZC3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GDE1Q9NZC3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GDE1Q9NZC3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GDE1Q9NZC3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GDE1Q9NZC3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GDE1Q9NZC3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GDE1Q9NZC3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GDE1Q9NZC3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GDE1Q9NZC3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GDE1Q9NZC3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GDE1Q9NZC3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GDE1Q9NZC3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GDE1Q9NZC3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
GDE1Q9NZC3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GDE1Q9NZC3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GDE1Q9NZC3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
GDE1Q9NZC3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GDE1Q9NZC3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GDE1Q9NZC3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GDE1Q9NZC3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
GDE1Q9NZC3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GDE1Q9NZC3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GDE1Q9NZC3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GDE1Q9NZC3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GDE1Q9NZC3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GDE1Q9NZC3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GDE1Q9NZC3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
GDE1Q9NZC3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GDE1Q9NZC3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GDE1Q9NZC3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GDE1Q9NZC3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GDE1Q9NZC3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GDE1Q9NZC3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GDE1Q9NZC3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GDE1Q9NZC3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
GDE1Q9NZC3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GDE1Q9NZC3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GDE1Q9NZC3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GDE1Q9NZC3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GDE1Q9NZC3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GDE1Q9NZC3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GDE1Q9NZC3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
GDE1Q9NZC3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
GDE1Q9NZC3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
GDE1Q9NZC3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GDE1Q9NZC3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GDE1Q9NZC3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GDE1Q9NZC3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GDE1Q9NZC3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GDE1Q9NZC3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GDE1Q9NZC3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GDE1Q9NZC3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
GDE1Q9NZC3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GDE1Q9NZC3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GDE1Q9NZC3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GDE1Q9NZC3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GDE1Q9NZC3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GDE1Q9NZC3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GDE1Q9NZC3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GDE1Q9NZC3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GDE1Q9NZC3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GDE1Q9NZC3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GDE1Q9NZC3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GDE1Q9NZC3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GDE1Q9NZC3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GDE1Q9NZC3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GDE1Q9NZC3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
GDE1Q9NZC3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
GDE1Q9NZC3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GDE1Q9NZC3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GDE1Q9NZC3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GDE1Q9NZC3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GDE1Q9NZC3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
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