Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV6

RRN3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, humanhuman

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Length 651 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3Q9NYV6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RRN3Q9NYV6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RRN3Q9NYV6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RRN3Q9NYV6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RRN3Q9NYV6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RRN3Q9NYV6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RRN3Q9NYV6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RRN3Q9NYV6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RRN3Q9NYV6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RRN3Q9NYV6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RRN3Q9NYV6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RRN3Q9NYV6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RRN3Q9NYV6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RRN3Q9NYV6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RRN3Q9NYV6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RRN3Q9NYV6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RRN3Q9NYV6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RRN3Q9NYV6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RRN3Q9NYV6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RRN3Q9NYV6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RRN3Q9NYV6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RRN3Q9NYV6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RRN3Q9NYV6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RRN3Q9NYV6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RRN3Q9NYV6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RRN3Q9NYV6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RRN3Q9NYV6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RRN3Q9NYV6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RRN3Q9NYV6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RRN3Q9NYV6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RRN3Q9NYV6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RRN3Q9NYV6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RRN3Q9NYV6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RRN3Q9NYV6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RRN3Q9NYV6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RRN3Q9NYV6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RRN3Q9NYV6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RRN3Q9NYV6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RRN3Q9NYV6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RRN3Q9NYV6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RRN3Q9NYV6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RRN3Q9NYV6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RRN3Q9NYV6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RRN3Q9NYV6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RRN3Q9NYV6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RRN3Q9NYV6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RRN3Q9NYV6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RRN3Q9NYV6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RRN3Q9NYV6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RRN3Q9NYV6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RRN3Q9NYV6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RRN3Q9NYV6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RRN3Q9NYV6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RRN3Q9NYV6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RRN3Q9NYV6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RRN3Q9NYV6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RRN3Q9NYV6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RRN3Q9NYV6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RRN3Q9NYV6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RRN3Q9NYV6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RRN3Q9NYV6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RRN3Q9NYV6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RRN3Q9NYV6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RRN3Q9NYV6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RRN3Q9NYV6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RRN3Q9NYV6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RRN3Q9NYV6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RRN3Q9NYV6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RRN3Q9NYV6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RRN3Q9NYV6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RRN3Q9NYV6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RRN3Q9NYV6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RRN3Q9NYV6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RRN3Q9NYV6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RRN3Q9NYV6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RRN3Q9NYV6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RRN3Q9NYV6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RRN3Q9NYV6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RRN3Q9NYV6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RRN3Q9NYV6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RRN3Q9NYV6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RRN3Q9NYV6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RRN3Q9NYV6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RRN3Q9NYV6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RRN3Q9NYV6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RRN3Q9NYV6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RRN3Q9NYV6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RRN3Q9NYV6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RRN3Q9NYV6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RRN3Q9NYV6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RRN3Q9NYV6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RRN3Q9NYV6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RRN3Q9NYV6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RRN3Q9NYV6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RRN3Q9NYV6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RRN3Q9NYV6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RRN3Q9NYV6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RRN3Q9NYV6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RRN3Q9NYV6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RRN3Q9NYV6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
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