Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXZ2

DDX43, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX43Q9NXZ2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDX43Q9NXZ2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDX43Q9NXZ2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDX43Q9NXZ2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDX43Q9NXZ2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDX43Q9NXZ2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDX43Q9NXZ2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDX43Q9NXZ2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDX43Q9NXZ2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDX43Q9NXZ2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDX43Q9NXZ2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDX43Q9NXZ2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDX43Q9NXZ2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDX43Q9NXZ2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDX43Q9NXZ2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDX43Q9NXZ2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDX43Q9NXZ2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDX43Q9NXZ2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDX43Q9NXZ2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDX43Q9NXZ2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDX43Q9NXZ2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDX43Q9NXZ2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDX43Q9NXZ2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDX43Q9NXZ2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDX43Q9NXZ2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDX43Q9NXZ2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDX43Q9NXZ2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDX43Q9NXZ2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDX43Q9NXZ2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDX43Q9NXZ2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDX43Q9NXZ2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDX43Q9NXZ2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDX43Q9NXZ2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDX43Q9NXZ2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDX43Q9NXZ2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDX43Q9NXZ2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDX43Q9NXZ2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDX43Q9NXZ2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDX43Q9NXZ2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
DDX43Q9NXZ2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDX43Q9NXZ2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDX43Q9NXZ2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDX43Q9NXZ2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DDX43Q9NXZ2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DDX43Q9NXZ2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DDX43Q9NXZ2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DDX43Q9NXZ2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
DDX43Q9NXZ2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
DDX43Q9NXZ2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
DDX43Q9NXZ2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
DDX43Q9NXZ2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
DDX43Q9NXZ2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDX43Q9NXZ2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
DDX43Q9NXZ2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDX43Q9NXZ2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDX43Q9NXZ2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDX43Q9NXZ2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDX43Q9NXZ2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DDX43Q9NXZ2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
DDX43Q9NXZ2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DDX43Q9NXZ2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DDX43Q9NXZ2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
DDX43Q9NXZ2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDX43Q9NXZ2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDX43Q9NXZ2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDX43Q9NXZ2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDX43Q9NXZ2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDX43Q9NXZ2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
DDX43Q9NXZ2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDX43Q9NXZ2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDX43Q9NXZ2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDX43Q9NXZ2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDX43Q9NXZ2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDX43Q9NXZ2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDX43Q9NXZ2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDX43Q9NXZ2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDX43Q9NXZ2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDX43Q9NXZ2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDX43Q9NXZ2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDX43Q9NXZ2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDX43Q9NXZ2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDX43Q9NXZ2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDX43Q9NXZ2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDX43Q9NXZ2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDX43Q9NXZ2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDX43Q9NXZ2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
DDX43Q9NXZ2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
DDX43Q9NXZ2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDX43Q9NXZ2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDX43Q9NXZ2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDX43Q9NXZ2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDX43Q9NXZ2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDX43Q9NXZ2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDX43Q9NXZ2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDX43Q9NXZ2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DDX43Q9NXZ2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DDX43Q9NXZ2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DDX43Q9NXZ2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
DDX43Q9NXZ2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DDX43Q9NXZ2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.9 ms