Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX52

RHBDL2, Rhomboid-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL2Q9NX52 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RHBDL2Q9NX52 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RHBDL2Q9NX52 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RHBDL2Q9NX52 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RHBDL2Q9NX52 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RHBDL2Q9NX52 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RHBDL2Q9NX52 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RHBDL2Q9NX52 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RHBDL2Q9NX52 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RHBDL2Q9NX52 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RHBDL2Q9NX52 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RHBDL2Q9NX52 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RHBDL2Q9NX52 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
RHBDL2Q9NX52 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RHBDL2Q9NX52 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RHBDL2Q9NX52 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RHBDL2Q9NX52 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RHBDL2Q9NX52 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RHBDL2Q9NX52 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RHBDL2Q9NX52 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RHBDL2Q9NX52 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RHBDL2Q9NX52 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RHBDL2Q9NX52 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RHBDL2Q9NX52 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RHBDL2Q9NX52 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RHBDL2Q9NX52 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RHBDL2Q9NX52 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RHBDL2Q9NX52 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
RHBDL2Q9NX52 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RHBDL2Q9NX52 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RHBDL2Q9NX52 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RHBDL2Q9NX52 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RHBDL2Q9NX52 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RHBDL2Q9NX52 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RHBDL2Q9NX52 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RHBDL2Q9NX52 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RHBDL2Q9NX52 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RHBDL2Q9NX52 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RHBDL2Q9NX52 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RHBDL2Q9NX52 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RHBDL2Q9NX52 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RHBDL2Q9NX52 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RHBDL2Q9NX52 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RHBDL2Q9NX52 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
RHBDL2Q9NX52 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RHBDL2Q9NX52 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RHBDL2Q9NX52 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RHBDL2Q9NX52 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RHBDL2Q9NX52 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RHBDL2Q9NX52 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RHBDL2Q9NX52 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RHBDL2Q9NX52 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RHBDL2Q9NX52 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RHBDL2Q9NX52 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RHBDL2Q9NX52 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RHBDL2Q9NX52 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RHBDL2Q9NX52 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RHBDL2Q9NX52 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RHBDL2Q9NX52 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RHBDL2Q9NX52 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RHBDL2Q9NX52 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RHBDL2Q9NX52 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
RHBDL2Q9NX52 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RHBDL2Q9NX52 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RHBDL2Q9NX52 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RHBDL2Q9NX52 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RHBDL2Q9NX52 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RHBDL2Q9NX52 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RHBDL2Q9NX52 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RHBDL2Q9NX52 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RHBDL2Q9NX52 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RHBDL2Q9NX52 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RHBDL2Q9NX52 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RHBDL2Q9NX52 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RHBDL2Q9NX52 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RHBDL2Q9NX52 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RHBDL2Q9NX52 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RHBDL2Q9NX52 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RHBDL2Q9NX52 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RHBDL2Q9NX52 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RHBDL2Q9NX52 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RHBDL2Q9NX52 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RHBDL2Q9NX52 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RHBDL2Q9NX52 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RHBDL2Q9NX52 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RHBDL2Q9NX52 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RHBDL2Q9NX52 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RHBDL2Q9NX52 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RHBDL2Q9NX52 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RHBDL2Q9NX52 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RHBDL2Q9NX52 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
RHBDL2Q9NX52 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RHBDL2Q9NX52 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RHBDL2Q9NX52 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RHBDL2Q9NX52 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RHBDL2Q9NX52 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
RHBDL2Q9NX52 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RHBDL2Q9NX52 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RHBDL2Q9NX52 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
RHBDL2Q9NX52 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms