Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVH1

DNAJC11, DnaJ homolog subfamily C member 11, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC11Q9NVH1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNAJC11Q9NVH1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNAJC11Q9NVH1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNAJC11Q9NVH1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNAJC11Q9NVH1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNAJC11Q9NVH1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNAJC11Q9NVH1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNAJC11Q9NVH1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNAJC11Q9NVH1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNAJC11Q9NVH1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNAJC11Q9NVH1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNAJC11Q9NVH1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNAJC11Q9NVH1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNAJC11Q9NVH1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNAJC11Q9NVH1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNAJC11Q9NVH1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNAJC11Q9NVH1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNAJC11Q9NVH1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
DNAJC11Q9NVH1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNAJC11Q9NVH1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNAJC11Q9NVH1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNAJC11Q9NVH1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DNAJC11Q9NVH1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNAJC11Q9NVH1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNAJC11Q9NVH1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNAJC11Q9NVH1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNAJC11Q9NVH1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNAJC11Q9NVH1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNAJC11Q9NVH1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNAJC11Q9NVH1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNAJC11Q9NVH1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNAJC11Q9NVH1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNAJC11Q9NVH1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNAJC11Q9NVH1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNAJC11Q9NVH1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNAJC11Q9NVH1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNAJC11Q9NVH1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNAJC11Q9NVH1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
DNAJC11Q9NVH1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNAJC11Q9NVH1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNAJC11Q9NVH1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
DNAJC11Q9NVH1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNAJC11Q9NVH1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNAJC11Q9NVH1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNAJC11Q9NVH1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNAJC11Q9NVH1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNAJC11Q9NVH1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
DNAJC11Q9NVH1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
DNAJC11Q9NVH1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNAJC11Q9NVH1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNAJC11Q9NVH1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
DNAJC11Q9NVH1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNAJC11Q9NVH1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNAJC11Q9NVH1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNAJC11Q9NVH1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNAJC11Q9NVH1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNAJC11Q9NVH1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNAJC11Q9NVH1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNAJC11Q9NVH1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNAJC11Q9NVH1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNAJC11Q9NVH1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNAJC11Q9NVH1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNAJC11Q9NVH1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNAJC11Q9NVH1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNAJC11Q9NVH1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNAJC11Q9NVH1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNAJC11Q9NVH1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNAJC11Q9NVH1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNAJC11Q9NVH1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DNAJC11Q9NVH1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DNAJC11Q9NVH1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DNAJC11Q9NVH1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DNAJC11Q9NVH1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DNAJC11Q9NVH1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DNAJC11Q9NVH1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DNAJC11Q9NVH1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
DNAJC11Q9NVH1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DNAJC11Q9NVH1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNAJC11Q9NVH1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
DNAJC11Q9NVH1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNAJC11Q9NVH1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNAJC11Q9NVH1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNAJC11Q9NVH1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
DNAJC11Q9NVH1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNAJC11Q9NVH1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNAJC11Q9NVH1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNAJC11Q9NVH1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNAJC11Q9NVH1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
DNAJC11Q9NVH1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNAJC11Q9NVH1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNAJC11Q9NVH1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNAJC11Q9NVH1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
DNAJC11Q9NVH1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNAJC11Q9NVH1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNAJC11Q9NVH1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNAJC11Q9NVH1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNAJC11Q9NVH1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNAJC11Q9NVH1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNAJC11Q9NVH1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
DNAJC11Q9NVH1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms