Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVC3

SLC38A7, Putative sodium-coupled neutral amino acid transporter 7, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A7Q9NVC3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC38A7Q9NVC3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC38A7Q9NVC3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC38A7Q9NVC3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC38A7Q9NVC3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC38A7Q9NVC3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC38A7Q9NVC3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC38A7Q9NVC3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC38A7Q9NVC3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC38A7Q9NVC3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC38A7Q9NVC3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC38A7Q9NVC3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC38A7Q9NVC3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC38A7Q9NVC3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC38A7Q9NVC3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC38A7Q9NVC3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC38A7Q9NVC3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC38A7Q9NVC3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC38A7Q9NVC3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC38A7Q9NVC3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC38A7Q9NVC3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC38A7Q9NVC3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC38A7Q9NVC3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC38A7Q9NVC3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC38A7Q9NVC3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC38A7Q9NVC3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC38A7Q9NVC3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC38A7Q9NVC3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC38A7Q9NVC3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC38A7Q9NVC3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC38A7Q9NVC3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC38A7Q9NVC3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC38A7Q9NVC3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC38A7Q9NVC3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC38A7Q9NVC3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC38A7Q9NVC3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC38A7Q9NVC3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC38A7Q9NVC3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC38A7Q9NVC3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC38A7Q9NVC3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC38A7Q9NVC3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC38A7Q9NVC3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC38A7Q9NVC3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC38A7Q9NVC3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC38A7Q9NVC3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC38A7Q9NVC3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC38A7Q9NVC3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC38A7Q9NVC3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC38A7Q9NVC3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC38A7Q9NVC3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC38A7Q9NVC3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC38A7Q9NVC3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC38A7Q9NVC3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC38A7Q9NVC3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC38A7Q9NVC3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC38A7Q9NVC3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC38A7Q9NVC3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC38A7Q9NVC3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC38A7Q9NVC3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC38A7Q9NVC3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC38A7Q9NVC3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC38A7Q9NVC3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC38A7Q9NVC3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC38A7Q9NVC3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC38A7Q9NVC3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC38A7Q9NVC3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC38A7Q9NVC3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC38A7Q9NVC3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC38A7Q9NVC3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC38A7Q9NVC3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC38A7Q9NVC3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC38A7Q9NVC3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC38A7Q9NVC3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC38A7Q9NVC3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC38A7Q9NVC3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC38A7Q9NVC3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC38A7Q9NVC3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SLC38A7Q9NVC3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SLC38A7Q9NVC3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SLC38A7Q9NVC3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC38A7Q9NVC3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC38A7Q9NVC3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC38A7Q9NVC3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC38A7Q9NVC3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC38A7Q9NVC3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC38A7Q9NVC3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC38A7Q9NVC3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC38A7Q9NVC3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC38A7Q9NVC3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC38A7Q9NVC3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC38A7Q9NVC3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC38A7Q9NVC3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC38A7Q9NVC3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC38A7Q9NVC3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC38A7Q9NVC3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC38A7Q9NVC3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC38A7Q9NVC3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC38A7Q9NVC3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC38A7Q9NVC3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC38A7Q9NVC3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 145.3 ms