Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV88

INTS9, Integrator complex subunit 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS9Q9NV88 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
INTS9Q9NV88 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
INTS9Q9NV88 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
INTS9Q9NV88 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
INTS9Q9NV88 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
INTS9Q9NV88 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
INTS9Q9NV88 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
INTS9Q9NV88 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
INTS9Q9NV88 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
INTS9Q9NV88 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
INTS9Q9NV88 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
INTS9Q9NV88 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
INTS9Q9NV88 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
INTS9Q9NV88 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
INTS9Q9NV88 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
INTS9Q9NV88 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
INTS9Q9NV88 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
INTS9Q9NV88 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
INTS9Q9NV88 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
INTS9Q9NV88 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
INTS9Q9NV88 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
INTS9Q9NV88 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
INTS9Q9NV88 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
INTS9Q9NV88 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
INTS9Q9NV88 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
INTS9Q9NV88 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
INTS9Q9NV88 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
INTS9Q9NV88 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
INTS9Q9NV88 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
INTS9Q9NV88 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
INTS9Q9NV88 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
INTS9Q9NV88 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
INTS9Q9NV88 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
INTS9Q9NV88 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
INTS9Q9NV88 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
INTS9Q9NV88 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
INTS9Q9NV88 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
INTS9Q9NV88 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
INTS9Q9NV88 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
INTS9Q9NV88 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
INTS9Q9NV88 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
INTS9Q9NV88 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
INTS9Q9NV88 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
INTS9Q9NV88 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
INTS9Q9NV88 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
INTS9Q9NV88 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
INTS9Q9NV88 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
INTS9Q9NV88 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
INTS9Q9NV88 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
INTS9Q9NV88 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
INTS9Q9NV88 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
INTS9Q9NV88 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
INTS9Q9NV88 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
INTS9Q9NV88 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
INTS9Q9NV88 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
INTS9Q9NV88 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
INTS9Q9NV88 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
INTS9Q9NV88 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
INTS9Q9NV88 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
INTS9Q9NV88 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
INTS9Q9NV88 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
INTS9Q9NV88 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
INTS9Q9NV88 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
INTS9Q9NV88 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
INTS9Q9NV88 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
INTS9Q9NV88 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
INTS9Q9NV88 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
INTS9Q9NV88 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
INTS9Q9NV88 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
INTS9Q9NV88 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
INTS9Q9NV88 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
INTS9Q9NV88 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
INTS9Q9NV88 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
INTS9Q9NV88 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
INTS9Q9NV88 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
INTS9Q9NV88 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
INTS9Q9NV88 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
INTS9Q9NV88 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
INTS9Q9NV88 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
INTS9Q9NV88 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
INTS9Q9NV88 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
INTS9Q9NV88 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
INTS9Q9NV88 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
INTS9Q9NV88 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
INTS9Q9NV88 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
INTS9Q9NV88 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
INTS9Q9NV88 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
INTS9Q9NV88 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
INTS9Q9NV88 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
INTS9Q9NV88 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
INTS9Q9NV88 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
INTS9Q9NV88 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
INTS9Q9NV88 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
INTS9Q9NV88 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
INTS9Q9NV88 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
INTS9Q9NV88 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
INTS9Q9NV88 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
INTS9Q9NV88 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
INTS9Q9NV88 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
INTS9Q9NV88 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms