Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU39

FOXD4L1, Forkhead box protein D4-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L1Q9NU39 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FOXD4L1Q9NU39 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FOXD4L1Q9NU39 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FOXD4L1Q9NU39 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FOXD4L1Q9NU39 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FOXD4L1Q9NU39 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FOXD4L1Q9NU39 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FOXD4L1Q9NU39 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FOXD4L1Q9NU39 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FOXD4L1Q9NU39 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FOXD4L1Q9NU39 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FOXD4L1Q9NU39 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FOXD4L1Q9NU39 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FOXD4L1Q9NU39 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FOXD4L1Q9NU39 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FOXD4L1Q9NU39 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FOXD4L1Q9NU39 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FOXD4L1Q9NU39 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FOXD4L1Q9NU39 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FOXD4L1Q9NU39 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FOXD4L1Q9NU39 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FOXD4L1Q9NU39 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FOXD4L1Q9NU39 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FOXD4L1Q9NU39 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FOXD4L1Q9NU39 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FOXD4L1Q9NU39 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FOXD4L1Q9NU39 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FOXD4L1Q9NU39 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FOXD4L1Q9NU39 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FOXD4L1Q9NU39 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FOXD4L1Q9NU39 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FOXD4L1Q9NU39 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FOXD4L1Q9NU39 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FOXD4L1Q9NU39 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FOXD4L1Q9NU39 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FOXD4L1Q9NU39 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FOXD4L1Q9NU39 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FOXD4L1Q9NU39 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
FOXD4L1Q9NU39 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
FOXD4L1Q9NU39 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
FOXD4L1Q9NU39 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
FOXD4L1Q9NU39 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
FOXD4L1Q9NU39 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
FOXD4L1Q9NU39 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
FOXD4L1Q9NU39 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
FOXD4L1Q9NU39 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
FOXD4L1Q9NU39 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
FOXD4L1Q9NU39 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FOXD4L1Q9NU39 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FOXD4L1Q9NU39 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FOXD4L1Q9NU39 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FOXD4L1Q9NU39 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FOXD4L1Q9NU39 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
FOXD4L1Q9NU39 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FOXD4L1Q9NU39 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FOXD4L1Q9NU39 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FOXD4L1Q9NU39 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FOXD4L1Q9NU39 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FOXD4L1Q9NU39 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FOXD4L1Q9NU39 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FOXD4L1Q9NU39 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
FOXD4L1Q9NU39 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FOXD4L1Q9NU39 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FOXD4L1Q9NU39 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FOXD4L1Q9NU39 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FOXD4L1Q9NU39 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FOXD4L1Q9NU39 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
FOXD4L1Q9NU39 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FOXD4L1Q9NU39 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FOXD4L1Q9NU39 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FOXD4L1Q9NU39 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FOXD4L1Q9NU39 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FOXD4L1Q9NU39 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FOXD4L1Q9NU39 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FOXD4L1Q9NU39 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
FOXD4L1Q9NU39 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FOXD4L1Q9NU39 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FOXD4L1Q9NU39 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FOXD4L1Q9NU39 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FOXD4L1Q9NU39 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FOXD4L1Q9NU39 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FOXD4L1Q9NU39 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FOXD4L1Q9NU39 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FOXD4L1Q9NU39 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FOXD4L1Q9NU39 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FOXD4L1Q9NU39 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FOXD4L1Q9NU39 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
FOXD4L1Q9NU39 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
FOXD4L1Q9NU39 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FOXD4L1Q9NU39 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FOXD4L1Q9NU39 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FOXD4L1Q9NU39 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
FOXD4L1Q9NU39 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FOXD4L1Q9NU39 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FOXD4L1Q9NU39 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FOXD4L1Q9NU39 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FOXD4L1Q9NU39 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FOXD4L1Q9NU39 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FOXD4L1Q9NU39 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FOXD4L1Q9NU39 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms