Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTI5

PDS5B, Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDS5BQ9NTI5 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC40.36■■■■■ 4.05
PDS5BQ9NTI5 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC40.36■■■■■ 4.05
PDS5BQ9NTI5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
PDS5BQ9NTI5 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
PDS5BQ9NTI5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.35■■■■■ 4.05
PDS5BQ9NTI5 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
PDS5BQ9NTI5 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC40.35■■■■■ 4.05
PDS5BQ9NTI5 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC40.35■■■■■ 4.05
PDS5BQ9NTI5 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.35■■■■■ 4.05
PDS5BQ9NTI5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
PDS5BQ9NTI5 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
PDS5BQ9NTI5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
PDS5BQ9NTI5 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC40.34■■■■■ 4.05
PDS5BQ9NTI5 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC40.34■■■■■ 4.05
PDS5BQ9NTI5 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC40.34■■■■■ 4.05
PDS5BQ9NTI5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
PDS5BQ9NTI5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
PDS5BQ9NTI5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.34■■■■■ 4.05
PDS5BQ9NTI5 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC40.33■■■■■ 4.05
PDS5BQ9NTI5 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC40.33■■■■■ 4.05
PDS5BQ9NTI5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
PDS5BQ9NTI5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
PDS5BQ9NTI5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC40.33■■■■■ 4.05
PDS5BQ9NTI5 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
PDS5BQ9NTI5 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC40.33■■■■■ 4.05
PDS5BQ9NTI5 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC40.33■■■■■ 4.05
PDS5BQ9NTI5 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC40.33■■■■■ 4.05
PDS5BQ9NTI5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.04
PDS5BQ9NTI5 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.04
PDS5BQ9NTI5 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.32■■■■■ 4.04
PDS5BQ9NTI5 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC40.32■■■■■ 4.04
PDS5BQ9NTI5 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC40.32■■■■■ 4.04
PDS5BQ9NTI5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC40.31■■■■■ 4.04
PDS5BQ9NTI5 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC40.31■■■■■ 4.04
PDS5BQ9NTI5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
PDS5BQ9NTI5 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
PDS5BQ9NTI5 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
PDS5BQ9NTI5 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC40.31■■■■■ 4.04
PDS5BQ9NTI5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC40.31■■■■■ 4.04
PDS5BQ9NTI5 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC40.3■■■■■ 4.04
PDS5BQ9NTI5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
PDS5BQ9NTI5 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
PDS5BQ9NTI5 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
PDS5BQ9NTI5 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.29■■■■■ 4.04
PDS5BQ9NTI5 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.29■■■■■ 4.04
PDS5BQ9NTI5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
PDS5BQ9NTI5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
PDS5BQ9NTI5 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.28■■■■■ 4.04
PDS5BQ9NTI5 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC40.28■■■■■ 4.04
PDS5BQ9NTI5 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.28■■■■■ 4.04
PDS5BQ9NTI5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
PDS5BQ9NTI5 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
PDS5BQ9NTI5 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.27■■■■■ 4.04
PDS5BQ9NTI5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
PDS5BQ9NTI5 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
PDS5BQ9NTI5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
PDS5BQ9NTI5 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC40.26■■■■■ 4.04
PDS5BQ9NTI5 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC40.26■■■■■ 4.04
PDS5BQ9NTI5 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC40.26■■■■■ 4.04
PDS5BQ9NTI5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
PDS5BQ9NTI5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC40.26■■■■■ 4.04
PDS5BQ9NTI5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.03
PDS5BQ9NTI5 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC40.25■■■■■ 4.03
PDS5BQ9NTI5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC40.25■■■■■ 4.03
PDS5BQ9NTI5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
PDS5BQ9NTI5 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.25■■■■■ 4.03
PDS5BQ9NTI5 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC40.25■■■■■ 4.03
PDS5BQ9NTI5 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC40.25■■■■■ 4.03
PDS5BQ9NTI5 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.25■■■■■ 4.03
PDS5BQ9NTI5 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC40.24■■■■■ 4.03
PDS5BQ9NTI5 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
PDS5BQ9NTI5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
PDS5BQ9NTI5 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.23■■■■■ 4.03
PDS5BQ9NTI5 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
PDS5BQ9NTI5 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC40.23■■■■■ 4.03
PDS5BQ9NTI5 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
PDS5BQ9NTI5 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
PDS5BQ9NTI5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.22■■■■■ 4.03
PDS5BQ9NTI5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
PDS5BQ9NTI5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
PDS5BQ9NTI5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.21■■■■■ 4.03
PDS5BQ9NTI5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
PDS5BQ9NTI5 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC40.21■■■■■ 4.03
PDS5BQ9NTI5 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC40.2■■■■■ 4.03
PDS5BQ9NTI5 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
PDS5BQ9NTI5 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC40.2■■■■■ 4.03
PDS5BQ9NTI5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
PDS5BQ9NTI5 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC40.19■■■■■ 4.02
PDS5BQ9NTI5 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC40.19■■■■■ 4.02
PDS5BQ9NTI5 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.19■■■■■ 4.02
PDS5BQ9NTI5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC40.19■■■■■ 4.02
PDS5BQ9NTI5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC40.19■■■■■ 4.02
PDS5BQ9NTI5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
PDS5BQ9NTI5 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
PDS5BQ9NTI5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC40.18■■■■■ 4.02
PDS5BQ9NTI5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
PDS5BQ9NTI5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC40.18■■■■■ 4.02
PDS5BQ9NTI5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC40.18■■■■■ 4.02
PDS5BQ9NTI5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC40.18■■■■■ 4.02
PDS5BQ9NTI5 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms