Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTG1

PKDREJ, Polycystic kidney disease and receptor for egg jelly-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDREJQ9NTG1 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PKDREJQ9NTG1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PKDREJQ9NTG1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PKDREJQ9NTG1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PKDREJQ9NTG1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PKDREJQ9NTG1 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PKDREJQ9NTG1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PKDREJQ9NTG1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PKDREJQ9NTG1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PKDREJQ9NTG1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PKDREJQ9NTG1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PKDREJQ9NTG1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PKDREJQ9NTG1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PKDREJQ9NTG1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PKDREJQ9NTG1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PKDREJQ9NTG1 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PKDREJQ9NTG1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PKDREJQ9NTG1 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PKDREJQ9NTG1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PKDREJQ9NTG1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PKDREJQ9NTG1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PKDREJQ9NTG1 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PKDREJQ9NTG1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PKDREJQ9NTG1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PKDREJQ9NTG1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PKDREJQ9NTG1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PKDREJQ9NTG1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PKDREJQ9NTG1 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PKDREJQ9NTG1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PKDREJQ9NTG1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PKDREJQ9NTG1 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PKDREJQ9NTG1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PKDREJQ9NTG1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PKDREJQ9NTG1 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PKDREJQ9NTG1 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PKDREJQ9NTG1 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PKDREJQ9NTG1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PKDREJQ9NTG1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PKDREJQ9NTG1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PKDREJQ9NTG1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PKDREJQ9NTG1 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PKDREJQ9NTG1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PKDREJQ9NTG1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PKDREJQ9NTG1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PKDREJQ9NTG1 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PKDREJQ9NTG1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PKDREJQ9NTG1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PKDREJQ9NTG1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PKDREJQ9NTG1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PKDREJQ9NTG1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PKDREJQ9NTG1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PKDREJQ9NTG1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PKDREJQ9NTG1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PKDREJQ9NTG1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PKDREJQ9NTG1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PKDREJQ9NTG1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PKDREJQ9NTG1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PKDREJQ9NTG1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PKDREJQ9NTG1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PKDREJQ9NTG1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PKDREJQ9NTG1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PKDREJQ9NTG1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PKDREJQ9NTG1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PKDREJQ9NTG1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PKDREJQ9NTG1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PKDREJQ9NTG1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PKDREJQ9NTG1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PKDREJQ9NTG1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PKDREJQ9NTG1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PKDREJQ9NTG1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PKDREJQ9NTG1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PKDREJQ9NTG1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PKDREJQ9NTG1 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PKDREJQ9NTG1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PKDREJQ9NTG1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PKDREJQ9NTG1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PKDREJQ9NTG1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PKDREJQ9NTG1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PKDREJQ9NTG1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PKDREJQ9NTG1 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PKDREJQ9NTG1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PKDREJQ9NTG1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PKDREJQ9NTG1 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PKDREJQ9NTG1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PKDREJQ9NTG1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PKDREJQ9NTG1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PKDREJQ9NTG1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PKDREJQ9NTG1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PKDREJQ9NTG1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PKDREJQ9NTG1 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PKDREJQ9NTG1 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PKDREJQ9NTG1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PKDREJQ9NTG1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PKDREJQ9NTG1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PKDREJQ9NTG1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PKDREJQ9NTG1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PKDREJQ9NTG1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PKDREJQ9NTG1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PKDREJQ9NTG1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PKDREJQ9NTG1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms