Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSE7

ABCC13, Putative ATP-binding cassette sub-family C member 13, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC13Q9NSE7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCC13Q9NSE7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCC13Q9NSE7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCC13Q9NSE7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCC13Q9NSE7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCC13Q9NSE7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCC13Q9NSE7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCC13Q9NSE7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCC13Q9NSE7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCC13Q9NSE7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCC13Q9NSE7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCC13Q9NSE7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCC13Q9NSE7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCC13Q9NSE7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCC13Q9NSE7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ABCC13Q9NSE7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ABCC13Q9NSE7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ABCC13Q9NSE7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ABCC13Q9NSE7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ABCC13Q9NSE7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ABCC13Q9NSE7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ABCC13Q9NSE7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ABCC13Q9NSE7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ABCC13Q9NSE7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ABCC13Q9NSE7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCC13Q9NSE7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCC13Q9NSE7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCC13Q9NSE7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCC13Q9NSE7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCC13Q9NSE7 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCC13Q9NSE7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCC13Q9NSE7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCC13Q9NSE7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCC13Q9NSE7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCC13Q9NSE7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCC13Q9NSE7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCC13Q9NSE7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCC13Q9NSE7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCC13Q9NSE7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCC13Q9NSE7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCC13Q9NSE7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCC13Q9NSE7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCC13Q9NSE7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCC13Q9NSE7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCC13Q9NSE7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCC13Q9NSE7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCC13Q9NSE7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCC13Q9NSE7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCC13Q9NSE7 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCC13Q9NSE7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCC13Q9NSE7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCC13Q9NSE7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCC13Q9NSE7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCC13Q9NSE7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCC13Q9NSE7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCC13Q9NSE7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCC13Q9NSE7 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCC13Q9NSE7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCC13Q9NSE7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCC13Q9NSE7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCC13Q9NSE7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCC13Q9NSE7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCC13Q9NSE7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCC13Q9NSE7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCC13Q9NSE7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCC13Q9NSE7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ABCC13Q9NSE7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ABCC13Q9NSE7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ABCC13Q9NSE7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ABCC13Q9NSE7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ABCC13Q9NSE7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ABCC13Q9NSE7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ABCC13Q9NSE7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ABCC13Q9NSE7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABCC13Q9NSE7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABCC13Q9NSE7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABCC13Q9NSE7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABCC13Q9NSE7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABCC13Q9NSE7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABCC13Q9NSE7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABCC13Q9NSE7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABCC13Q9NSE7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ABCC13Q9NSE7 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ABCC13Q9NSE7 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ABCC13Q9NSE7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ABCC13Q9NSE7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ABCC13Q9NSE7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ABCC13Q9NSE7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ABCC13Q9NSE7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ABCC13Q9NSE7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ABCC13Q9NSE7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ABCC13Q9NSE7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ABCC13Q9NSE7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ABCC13Q9NSE7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ABCC13Q9NSE7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ABCC13Q9NSE7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ABCC13Q9NSE7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ABCC13Q9NSE7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ABCC13Q9NSE7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ABCC13Q9NSE7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 286.5 ms