Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS71

GKN1, Gastrokine-1, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKN1Q9NS71 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GKN1Q9NS71 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GKN1Q9NS71 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GKN1Q9NS71 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GKN1Q9NS71 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GKN1Q9NS71 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GKN1Q9NS71 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GKN1Q9NS71 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GKN1Q9NS71 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GKN1Q9NS71 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GKN1Q9NS71 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GKN1Q9NS71 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GKN1Q9NS71 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GKN1Q9NS71 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GKN1Q9NS71 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GKN1Q9NS71 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GKN1Q9NS71 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GKN1Q9NS71 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GKN1Q9NS71 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GKN1Q9NS71 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GKN1Q9NS71 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GKN1Q9NS71 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GKN1Q9NS71 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GKN1Q9NS71 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GKN1Q9NS71 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GKN1Q9NS71 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GKN1Q9NS71 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GKN1Q9NS71 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GKN1Q9NS71 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GKN1Q9NS71 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GKN1Q9NS71 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GKN1Q9NS71 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GKN1Q9NS71 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GKN1Q9NS71 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GKN1Q9NS71 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GKN1Q9NS71 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GKN1Q9NS71 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GKN1Q9NS71 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
GKN1Q9NS71 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GKN1Q9NS71 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GKN1Q9NS71 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GKN1Q9NS71 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GKN1Q9NS71 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GKN1Q9NS71 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GKN1Q9NS71 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GKN1Q9NS71 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GKN1Q9NS71 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GKN1Q9NS71 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GKN1Q9NS71 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GKN1Q9NS71 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GKN1Q9NS71 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GKN1Q9NS71 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GKN1Q9NS71 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GKN1Q9NS71 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GKN1Q9NS71 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GKN1Q9NS71 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GKN1Q9NS71 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GKN1Q9NS71 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GKN1Q9NS71 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GKN1Q9NS71 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GKN1Q9NS71 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GKN1Q9NS71 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GKN1Q9NS71 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GKN1Q9NS71 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GKN1Q9NS71 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GKN1Q9NS71 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GKN1Q9NS71 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GKN1Q9NS71 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GKN1Q9NS71 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GKN1Q9NS71 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GKN1Q9NS71 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GKN1Q9NS71 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GKN1Q9NS71 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GKN1Q9NS71 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GKN1Q9NS71 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GKN1Q9NS71 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GKN1Q9NS71 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GKN1Q9NS71 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GKN1Q9NS71 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GKN1Q9NS71 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GKN1Q9NS71 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GKN1Q9NS71 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GKN1Q9NS71 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GKN1Q9NS71 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GKN1Q9NS71 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GKN1Q9NS71 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GKN1Q9NS71 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GKN1Q9NS71 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GKN1Q9NS71 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GKN1Q9NS71 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GKN1Q9NS71 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24■■□□□ 1.43
GKN1Q9NS71 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GKN1Q9NS71 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GKN1Q9NS71 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GKN1Q9NS71 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GKN1Q9NS71 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24■■□□□ 1.43
GKN1Q9NS71 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
GKN1Q9NS71 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GKN1Q9NS71 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GKN1Q9NS71 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms