Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQT4

EXOSC5, Exosome complex component RRP46, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC5Q9NQT4 ANAPC10-201ENST00000309439 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.561e-6■■■■■ 31.3
EXOSC5Q9NQT4 ANAPC10-212ENST00000511466 687 ntTSL 24.85□□□□□ -1.631e-6■■■■■ 31.3
EXOSC5Q9NQT4 MECP2-213ENST00000622433 1071 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.653e-7■■■■■ 31.2
EXOSC5Q9NQT4 MECP2-226ENST00000640414 897 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.853e-7■■■■■ 31.2
EXOSC5Q9NQT4 MECP2-212ENST00000611468 603 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.923e-7■■■■■ 31.2
EXOSC5Q9NQT4 MECP2-223ENST00000637791 101 ntTSL 54.28□□□□□ -1.723e-7■■■■■ 31.2
EXOSC5Q9NQT4 CCDC138-203ENST00000412964 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.511e-6■■■■■ 31.2
EXOSC5Q9NQT4 CCDC138-202ENST00000409529 2364 ntTSL 211.4□□□□□ -0.581e-6■■■■■ 31.2
EXOSC5Q9NQT4 CCDC138-201ENST00000295124 2383 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.621e-6■■■■■ 31.2
EXOSC5Q9NQT4 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.36e-7■■■■■ 31.2
EXOSC5Q9NQT4 PKN2-203ENST00000370521 6121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.666e-7■■■■■ 31.2
EXOSC5Q9NQT4 PKN2-202ENST00000370513 2890 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.586e-7■■■■■ 31.2
EXOSC5Q9NQT4 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.257e-7■■■■■ 31.2
EXOSC5Q9NQT4 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.057e-7■■■■■ 31.2
EXOSC5Q9NQT4 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.067e-7■■■■■ 31.2
EXOSC5Q9NQT4 NDUFA10-201ENST00000252711 4915 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.477e-7■■■■■ 31.2
EXOSC5Q9NQT4 NDUFA10-207ENST00000443626 776 ntTSL 511.24□□□□□ -0.617e-7■■■■■ 31.2
EXOSC5Q9NQT4 NDUFA10-212ENST00000485344 4509 ntTSL 211.05□□□□□ -0.647e-7■■■■■ 31.2
EXOSC5Q9NQT4 NDUFA10-206ENST00000419408 662 ntTSL 59.12□□□□□ -0.957e-7■■■■■ 31.2
EXOSC5Q9NQT4 NDUFA10-211ENST00000476216 817 ntTSL 27.39□□□□□ -1.237e-7■■■■■ 31.2
EXOSC5Q9NQT4 NDUFA10-208ENST00000444548 621 ntTSL 36.72□□□□□ -1.337e-7■■■■■ 31.2
EXOSC5Q9NQT4 NDUFA10-209ENST00000448880 434 ntTSL 51.94□□□□□ -2.17e-7■■■■■ 31.2
EXOSC5Q9NQT4 SNX14-217ENST00000514419 863 ntTSL 315.43■□□□□ 0.064e-7■■■■■ 31.2
EXOSC5Q9NQT4 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.064e-7■■■■■ 31.2
EXOSC5Q9NQT4 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.224e-7■■■■■ 31.2
EXOSC5Q9NQT4 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.294e-7■■■■■ 31.2
EXOSC5Q9NQT4 SNX14-204ENST00000369635 2578 ntTSL 513.11□□□□□ -0.314e-7■■■■■ 31.2
EXOSC5Q9NQT4 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.374e-7■■■■■ 31.2
EXOSC5Q9NQT4 SNX14-214ENST00000509338 505 ntTSL 311.98□□□□□ -0.494e-7■■■■■ 31.2
EXOSC5Q9NQT4 SNX14-201ENST00000314673 3486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.64e-7■■■■■ 31.2
EXOSC5Q9NQT4 AL589666.1-201ENST00000503906 835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.844e-7■■■■■ 31.2
EXOSC5Q9NQT4 SNX14-219ENST00000515216 3288 ntTSL 58.27□□□□□ -1.094e-7■■■■■ 31.2
EXOSC5Q9NQT4 SNX14-216ENST00000513869 530 ntTSL 42.58□□□□□ -24e-7■■■■■ 31.2
EXOSC5Q9NQT4 DCTN4-207ENST00000519313 647 ntTSL 511.1□□□□□ -0.633e-7■■■■■ 31.2
EXOSC5Q9NQT4 DCTN4-210ENST00000521093 473 ntTSL 49.64□□□□□ -0.873e-7■■■■■ 31.2
EXOSC5Q9NQT4 DCTN4-215ENST00000627368 1774 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -13e-7■■■■■ 31.2
EXOSC5Q9NQT4 DCTN4-203ENST00000447998 4208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.063e-7■■■■■ 31.2
EXOSC5Q9NQT4 DCTN4-202ENST00000446090 1737 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.13e-7■■■■■ 31.2
EXOSC5Q9NQT4 DCTN4-211ENST00000521448 585 ntTSL 57.62□□□□□ -1.193e-7■■■■■ 31.2
EXOSC5Q9NQT4 DCTN4-205ENST00000518015 579 ntTSL 37.11□□□□□ -1.273e-7■■■■■ 31.2
EXOSC5Q9NQT4 DCTN4-212ENST00000521533 578 ntTSL 47.1□□□□□ -1.273e-7■■■■■ 31.2
EXOSC5Q9NQT4 DCTN4-201ENST00000424236 4054 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.673e-7■■■■■ 31.2
EXOSC5Q9NQT4 MIER2-201ENST00000264819 6884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.521e-6■■■■■ 31.1
EXOSC5Q9NQT4 YIPF6-203ENST00000451537 1070 ntTSL 216.21■□□□□ 0.191e-6■■■■■ 31.1
EXOSC5Q9NQT4 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.361e-6■■■■■ 31.1
EXOSC5Q9NQT4 YIPF6-201ENST00000374622 6134 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.491e-6■■■■■ 31.1
EXOSC5Q9NQT4 YIPF6-202ENST00000374643 734 ntTSL 310.31□□□□□ -0.761e-6■■■■■ 31.1
EXOSC5Q9NQT4 RABGAP1L-209ENST00000457696 1847 ntTSL 1 (best)11.26□□□□□ -0.611e-6■■■■■ 31
EXOSC5Q9NQT4 FAM208B-205ENST00000473789 506 ntTSL 518.59■□□□□ 0.572e-8■■■■■ 31
EXOSC5Q9NQT4 FAM208B-210ENST00000496681 522 ntTSL 318.22■□□□□ 0.512e-8■■■■■ 31
EXOSC5Q9NQT4 FAM208B-213ENST00000532424 433 ntTSL 317.38■□□□□ 0.372e-8■■■■■ 31
EXOSC5Q9NQT4 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.082e-8■■■■■ 31
EXOSC5Q9NQT4 FAM208B-207ENST00000480839 540 ntTSL 314.96□□□□□ -0.012e-8■■■■■ 31
EXOSC5Q9NQT4 FAM208B-206ENST00000477043 514 ntTSL 213.21□□□□□ -0.292e-8■■■■■ 31
EXOSC5Q9NQT4 FAM208B-208ENST00000482419 424 ntTSL 23.55□□□□□ -1.842e-8■■■■■ 31
EXOSC5Q9NQT4 FAM208B-204ENST00000463468 560 ntTSL 33.46□□□□□ -1.862e-8■■■■■ 31
EXOSC5Q9NQT4 GALK2-213ENST00000559580 655 ntTSL 510.77□□□□□ -0.699e-7■■■■■ 31
EXOSC5Q9NQT4 GALK2-205ENST00000558399 805 ntTSL 58.59□□□□□ -1.039e-7■■■■■ 31
EXOSC5Q9NQT4 KIDINS220-211ENST00000496725 562 ntTSL 413.12□□□□□ -0.311e-11■■■■■ 31
EXOSC5Q9NQT4 KIDINS220-209ENST00000489024 4084 ntTSL 57.58□□□□□ -1.21e-11■■■■■ 31
EXOSC5Q9NQT4 KIDINS220-206ENST00000473731 7248 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.311e-11■■■■■ 31
EXOSC5Q9NQT4 KIDINS220-202ENST00000319688 3765 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.311e-11■■■■■ 31
EXOSC5Q9NQT4 KIDINS220-201ENST00000256707 7361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.311e-11■■■■■ 31
EXOSC5Q9NQT4 KIDINS220-208ENST00000488729 5988 ntTSL 1 (best)5.8□□□□□ -1.481e-11■■■■■ 31
EXOSC5Q9NQT4 KIDINS220-212ENST00000569008 8735 ntTSL 55.44□□□□□ -1.541e-11■■■■■ 31
EXOSC5Q9NQT4 PRELID2-208ENST00000515161 419 ntTSL 37.11□□□□□ -1.271e-7■■■■■ 31
EXOSC5Q9NQT4 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.179e-8■■■■■ 31
EXOSC5Q9NQT4 TRA2B-214ENST00000487615 4485 ntTSL 1 (best)10.49□□□□□ -0.735e-8■■■■■ 31
EXOSC5Q9NQT4 TRA2B-212ENST00000480461 538 ntTSL 1 (best)9.97□□□□□ -0.819e-8■■■■■ 31
EXOSC5Q9NQT4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.319e-7■■■■■ 30.9
EXOSC5Q9NQT4 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.439e-7■■■■■ 30.9
EXOSC5Q9NQT4 FBXO31-208ENST00000636077 660 ntTSL 517.63■□□□□ 0.419e-7■■■■■ 30.9
EXOSC5Q9NQT4 PXDC1-203ENST00000477592 1697 ntTSL 514.69□□□□□ -0.069e-7■■■■■ 30.9
EXOSC5Q9NQT4 NDUFAF5-201ENST00000378081 2409 ntTSL 213.26□□□□□ -0.299e-7■■■■■ 30.9
EXOSC5Q9NQT4 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.389e-7■■■■■ 30.9
EXOSC5Q9NQT4 PXDC1-201ENST00000380277 1538 ntTSL 312.64□□□□□ -0.399e-7■■■■■ 30.9
EXOSC5Q9NQT4 FBXO31-202ENST00000561664 305 ntTSL 511.22□□□□□ -0.619e-7■■■■■ 30.9
EXOSC5Q9NQT4 NDUFAF5-213ENST00000481249 676 ntTSL 511.13□□□□□ -0.639e-7■■■■■ 30.9
EXOSC5Q9NQT4 NDUFAF5-206ENST00000475968 933 ntTSL 511.13□□□□□ -0.639e-7■■■■■ 30.9
EXOSC5Q9NQT4 NDUFAF5-202ENST00000378106 5529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.849e-7■■■■■ 30.9
EXOSC5Q9NQT4 NDUFAF5-212ENST00000479716 493 ntTSL 37.22□□□□□ -1.259e-7■■■■■ 30.9
EXOSC5Q9NQT4 NDUFAF5-209ENST00000476536 763 ntTSL 55.22□□□□□ -1.579e-7■■■■■ 30.9
EXOSC5Q9NQT4 NDUFAF5-216ENST00000487478 634 ntTSL 34.09□□□□□ -1.759e-7■■■■■ 30.9
EXOSC5Q9NQT4 DNAJC3-202ENST00000602402 5591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.547e-7■■■■■ 30.9
EXOSC5Q9NQT4 DNAJC3-201ENST00000376795 2273 ntTSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.117e-7■■■■■ 30.9
EXOSC5Q9NQT4 CENPC-205ENST00000510189 2917 ntTSL 1 (best)10.15□□□□□ -0.781e-6■■■■■ 30.9
EXOSC5Q9NQT4 ZNF124-202ENST00000472531 2243 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.536e-7■■■■■ 30.8
EXOSC5Q9NQT4 KIAA1328-202ENST00000586135 1863 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.471e-7■■■■■ 30.8
EXOSC5Q9NQT4 CCDC18-AS1-205ENST00000421202 2973 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.53e-8■■■■■ 30.8
EXOSC5Q9NQT4 CCDC18-AS1-218ENST00000450843 600 ntTSL 55.25□□□□□ -1.573e-8■■■■■ 30.8
EXOSC5Q9NQT4 CCDC18-AS1-212ENST00000440778 596 ntTSL 54.97□□□□□ -1.613e-8■■■■■ 30.8
EXOSC5Q9NQT4 PRIM2-203ENST00000419977 2197 ntTSL 24.79□□□□□ -1.643e-8■■■■■ 30.8
EXOSC5Q9NQT4 CCDC18-AS1-209ENST00000432741 535 ntTSL 34.39□□□□□ -1.713e-8■■■■■ 30.8
EXOSC5Q9NQT4 CCDC18-AS1-210ENST00000436200 492 ntTSL 33.78□□□□□ -1.83e-8■■■■■ 30.8
EXOSC5Q9NQT4 KIAA1328-208ENST00000591911 496 ntTSL 53.24□□□□□ -1.891e-7■■■■■ 30.8
EXOSC5Q9NQT4 LINC01572-206ENST00000624829 1666 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.923e-7■■■■■ 30.8
EXOSC5Q9NQT4 LINC01572-201ENST00000561611 2194 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.213e-7■■■■■ 30.8
EXOSC5Q9NQT4 LINC01572-202ENST00000563770 568 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.263e-7■■■■■ 30.8
EXOSC5Q9NQT4 LINC01572-203ENST00000563823 563 ntTSL 4 BASIC6.96□□□□□ -1.33e-7■■■■■ 30.8
EXOSC5Q9NQT4 LINC01572-204ENST00000570035 831 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.363e-7■■■■■ 30.8
Retrieved 100 of 8,799 protein–RNA pairs in 50 ms