Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEMA4BQ9NPR2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEMA4BQ9NPR2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEMA4BQ9NPR2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEMA4BQ9NPR2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEMA4BQ9NPR2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEMA4BQ9NPR2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEMA4BQ9NPR2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEMA4BQ9NPR2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SEMA4BQ9NPR2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEMA4BQ9NPR2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEMA4BQ9NPR2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEMA4BQ9NPR2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEMA4BQ9NPR2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEMA4BQ9NPR2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEMA4BQ9NPR2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEMA4BQ9NPR2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA4BQ9NPR2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA4BQ9NPR2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA4BQ9NPR2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA4BQ9NPR2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA4BQ9NPR2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA4BQ9NPR2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA4BQ9NPR2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA4BQ9NPR2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA4BQ9NPR2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA4BQ9NPR2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA4BQ9NPR2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA4BQ9NPR2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SEMA4BQ9NPR2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEMA4BQ9NPR2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEMA4BQ9NPR2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEMA4BQ9NPR2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEMA4BQ9NPR2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEMA4BQ9NPR2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA4BQ9NPR2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA4BQ9NPR2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA4BQ9NPR2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA4BQ9NPR2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA4BQ9NPR2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA4BQ9NPR2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA4BQ9NPR2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA4BQ9NPR2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA4BQ9NPR2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA4BQ9NPR2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA4BQ9NPR2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA4BQ9NPR2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA4BQ9NPR2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA4BQ9NPR2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA4BQ9NPR2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA4BQ9NPR2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA4BQ9NPR2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA4BQ9NPR2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA4BQ9NPR2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA4BQ9NPR2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA4BQ9NPR2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA4BQ9NPR2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA4BQ9NPR2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA4BQ9NPR2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA4BQ9NPR2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA4BQ9NPR2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA4BQ9NPR2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA4BQ9NPR2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA4BQ9NPR2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA4BQ9NPR2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA4BQ9NPR2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA4BQ9NPR2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA4BQ9NPR2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA4BQ9NPR2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA4BQ9NPR2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA4BQ9NPR2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA4BQ9NPR2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA4BQ9NPR2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA4BQ9NPR2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA4BQ9NPR2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA4BQ9NPR2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA4BQ9NPR2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SEMA4BQ9NPR2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA4BQ9NPR2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA4BQ9NPR2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA4BQ9NPR2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA4BQ9NPR2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA4BQ9NPR2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA4BQ9NPR2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA4BQ9NPR2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA4BQ9NPR2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA4BQ9NPR2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA4BQ9NPR2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA4BQ9NPR2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA4BQ9NPR2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA4BQ9NPR2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA4BQ9NPR2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA4BQ9NPR2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA4BQ9NPR2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA4BQ9NPR2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA4BQ9NPR2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA4BQ9NPR2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA4BQ9NPR2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA4BQ9NPR2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA4BQ9NPR2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms