Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPJ6

MED4, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED4Q9NPJ6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MED4Q9NPJ6 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MED4Q9NPJ6 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
MED4Q9NPJ6 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MED4Q9NPJ6 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MED4Q9NPJ6 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MED4Q9NPJ6 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MED4Q9NPJ6 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MED4Q9NPJ6 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MED4Q9NPJ6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MED4Q9NPJ6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MED4Q9NPJ6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MED4Q9NPJ6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MED4Q9NPJ6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MED4Q9NPJ6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
MED4Q9NPJ6 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MED4Q9NPJ6 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MED4Q9NPJ6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MED4Q9NPJ6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MED4Q9NPJ6 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MED4Q9NPJ6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MED4Q9NPJ6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MED4Q9NPJ6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
MED4Q9NPJ6 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MED4Q9NPJ6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MED4Q9NPJ6 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MED4Q9NPJ6 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MED4Q9NPJ6 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MED4Q9NPJ6 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MED4Q9NPJ6 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MED4Q9NPJ6 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MED4Q9NPJ6 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MED4Q9NPJ6 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MED4Q9NPJ6 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MED4Q9NPJ6 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MED4Q9NPJ6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MED4Q9NPJ6 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MED4Q9NPJ6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MED4Q9NPJ6 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MED4Q9NPJ6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MED4Q9NPJ6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MED4Q9NPJ6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MED4Q9NPJ6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
MED4Q9NPJ6 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MED4Q9NPJ6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MED4Q9NPJ6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MED4Q9NPJ6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MED4Q9NPJ6 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MED4Q9NPJ6 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MED4Q9NPJ6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MED4Q9NPJ6 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MED4Q9NPJ6 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MED4Q9NPJ6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MED4Q9NPJ6 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MED4Q9NPJ6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MED4Q9NPJ6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MED4Q9NPJ6 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
MED4Q9NPJ6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MED4Q9NPJ6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MED4Q9NPJ6 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MED4Q9NPJ6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MED4Q9NPJ6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MED4Q9NPJ6 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MED4Q9NPJ6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MED4Q9NPJ6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MED4Q9NPJ6 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MED4Q9NPJ6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MED4Q9NPJ6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MED4Q9NPJ6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MED4Q9NPJ6 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MED4Q9NPJ6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MED4Q9NPJ6 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MED4Q9NPJ6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MED4Q9NPJ6 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MED4Q9NPJ6 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MED4Q9NPJ6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MED4Q9NPJ6 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MED4Q9NPJ6 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MED4Q9NPJ6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MED4Q9NPJ6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MED4Q9NPJ6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MED4Q9NPJ6 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MED4Q9NPJ6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MED4Q9NPJ6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MED4Q9NPJ6 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MED4Q9NPJ6 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MED4Q9NPJ6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MED4Q9NPJ6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MED4Q9NPJ6 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MED4Q9NPJ6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MED4Q9NPJ6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MED4Q9NPJ6 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MED4Q9NPJ6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MED4Q9NPJ6 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MED4Q9NPJ6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MED4Q9NPJ6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MED4Q9NPJ6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MED4Q9NPJ6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MED4Q9NPJ6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MED4Q9NPJ6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms