Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
A4GALTQ9NPC4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
A4GALTQ9NPC4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
A4GALTQ9NPC4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
A4GALTQ9NPC4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
A4GALTQ9NPC4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
A4GALTQ9NPC4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
A4GALTQ9NPC4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
A4GALTQ9NPC4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
A4GALTQ9NPC4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
A4GALTQ9NPC4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
A4GALTQ9NPC4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
A4GALTQ9NPC4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
A4GALTQ9NPC4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
A4GALTQ9NPC4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
A4GALTQ9NPC4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
A4GALTQ9NPC4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
A4GALTQ9NPC4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
A4GALTQ9NPC4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
A4GALTQ9NPC4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
A4GALTQ9NPC4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
A4GALTQ9NPC4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
A4GALTQ9NPC4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
A4GALTQ9NPC4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
A4GALTQ9NPC4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
A4GALTQ9NPC4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
A4GALTQ9NPC4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
A4GALTQ9NPC4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
A4GALTQ9NPC4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
A4GALTQ9NPC4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
A4GALTQ9NPC4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
A4GALTQ9NPC4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
A4GALTQ9NPC4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
A4GALTQ9NPC4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
A4GALTQ9NPC4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
A4GALTQ9NPC4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
A4GALTQ9NPC4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
A4GALTQ9NPC4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
A4GALTQ9NPC4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
A4GALTQ9NPC4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
A4GALTQ9NPC4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
A4GALTQ9NPC4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
A4GALTQ9NPC4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
A4GALTQ9NPC4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
A4GALTQ9NPC4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
A4GALTQ9NPC4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
A4GALTQ9NPC4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
A4GALTQ9NPC4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
A4GALTQ9NPC4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
A4GALTQ9NPC4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
A4GALTQ9NPC4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
A4GALTQ9NPC4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
A4GALTQ9NPC4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
A4GALTQ9NPC4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
A4GALTQ9NPC4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
A4GALTQ9NPC4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
A4GALTQ9NPC4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
A4GALTQ9NPC4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
A4GALTQ9NPC4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
A4GALTQ9NPC4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
A4GALTQ9NPC4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
A4GALTQ9NPC4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
A4GALTQ9NPC4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
A4GALTQ9NPC4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
A4GALTQ9NPC4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
A4GALTQ9NPC4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
A4GALTQ9NPC4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
A4GALTQ9NPC4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
A4GALTQ9NPC4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
A4GALTQ9NPC4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
A4GALTQ9NPC4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
A4GALTQ9NPC4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
A4GALTQ9NPC4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
A4GALTQ9NPC4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
A4GALTQ9NPC4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
A4GALTQ9NPC4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
A4GALTQ9NPC4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
A4GALTQ9NPC4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
A4GALTQ9NPC4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
A4GALTQ9NPC4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
A4GALTQ9NPC4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
A4GALTQ9NPC4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
A4GALTQ9NPC4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
A4GALTQ9NPC4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
A4GALTQ9NPC4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
A4GALTQ9NPC4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
A4GALTQ9NPC4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
A4GALTQ9NPC4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
A4GALTQ9NPC4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
A4GALTQ9NPC4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
A4GALTQ9NPC4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
A4GALTQ9NPC4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
A4GALTQ9NPC4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
A4GALTQ9NPC4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
A4GALTQ9NPC4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
A4GALTQ9NPC4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
A4GALTQ9NPC4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
A4GALTQ9NPC4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
A4GALTQ9NPC4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
A4GALTQ9NPC4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms