Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP99

TREM1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREM1Q9NP99 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TREM1Q9NP99 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TREM1Q9NP99 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TREM1Q9NP99 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TREM1Q9NP99 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TREM1Q9NP99 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TREM1Q9NP99 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TREM1Q9NP99 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TREM1Q9NP99 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TREM1Q9NP99 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TREM1Q9NP99 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TREM1Q9NP99 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TREM1Q9NP99 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TREM1Q9NP99 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TREM1Q9NP99 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TREM1Q9NP99 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TREM1Q9NP99 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TREM1Q9NP99 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TREM1Q9NP99 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TREM1Q9NP99 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TREM1Q9NP99 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TREM1Q9NP99 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TREM1Q9NP99 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TREM1Q9NP99 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TREM1Q9NP99 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TREM1Q9NP99 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TREM1Q9NP99 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TREM1Q9NP99 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TREM1Q9NP99 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TREM1Q9NP99 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TREM1Q9NP99 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TREM1Q9NP99 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TREM1Q9NP99 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TREM1Q9NP99 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TREM1Q9NP99 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TREM1Q9NP99 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TREM1Q9NP99 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TREM1Q9NP99 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TREM1Q9NP99 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TREM1Q9NP99 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TREM1Q9NP99 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TREM1Q9NP99 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TREM1Q9NP99 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TREM1Q9NP99 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TREM1Q9NP99 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TREM1Q9NP99 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TREM1Q9NP99 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
TREM1Q9NP99 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TREM1Q9NP99 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TREM1Q9NP99 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TREM1Q9NP99 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TREM1Q9NP99 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TREM1Q9NP99 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TREM1Q9NP99 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TREM1Q9NP99 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TREM1Q9NP99 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TREM1Q9NP99 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TREM1Q9NP99 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TREM1Q9NP99 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TREM1Q9NP99 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TREM1Q9NP99 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TREM1Q9NP99 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TREM1Q9NP99 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TREM1Q9NP99 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TREM1Q9NP99 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TREM1Q9NP99 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TREM1Q9NP99 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TREM1Q9NP99 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TREM1Q9NP99 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TREM1Q9NP99 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TREM1Q9NP99 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TREM1Q9NP99 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TREM1Q9NP99 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TREM1Q9NP99 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TREM1Q9NP99 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TREM1Q9NP99 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TREM1Q9NP99 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TREM1Q9NP99 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TREM1Q9NP99 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TREM1Q9NP99 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TREM1Q9NP99 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TREM1Q9NP99 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TREM1Q9NP99 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TREM1Q9NP99 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TREM1Q9NP99 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TREM1Q9NP99 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TREM1Q9NP99 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TREM1Q9NP99 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TREM1Q9NP99 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TREM1Q9NP99 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TREM1Q9NP99 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TREM1Q9NP99 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TREM1Q9NP99 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TREM1Q9NP99 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TREM1Q9NP99 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TREM1Q9NP99 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TREM1Q9NP99 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TREM1Q9NP99 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TREM1Q9NP99 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TREM1Q9NP99 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms