Protein–RNA interactions for Protein: Q9N2J8

HERV-H_2q24.1 provirus ancestral Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9N2J8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q9N2J8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q9N2J8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q9N2J8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q9N2J8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q9N2J8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q9N2J8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Q9N2J8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q9N2J8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q9N2J8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q9N2J8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q9N2J8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q9N2J8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q9N2J8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q9N2J8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q9N2J8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q9N2J8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q9N2J8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q9N2J8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q9N2J8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q9N2J8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q9N2J8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q9N2J8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q9N2J8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q9N2J8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q9N2J8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q9N2J8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q9N2J8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q9N2J8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q9N2J8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Q9N2J8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q9N2J8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Q9N2J8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q9N2J8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q9N2J8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q9N2J8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q9N2J8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q9N2J8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q9N2J8 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q9N2J8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q9N2J8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q9N2J8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q9N2J8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q9N2J8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q9N2J8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q9N2J8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Q9N2J8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q9N2J8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q9N2J8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q9N2J8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q9N2J8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q9N2J8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q9N2J8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q9N2J8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q9N2J8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q9N2J8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q9N2J8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q9N2J8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9N2J8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9N2J8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9N2J8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9N2J8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9N2J8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9N2J8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9N2J8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9N2J8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9N2J8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9N2J8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9N2J8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q9N2J8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q9N2J8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q9N2J8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q9N2J8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q9N2J8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q9N2J8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q9N2J8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q9N2J8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q9N2J8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q9N2J8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q9N2J8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q9N2J8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q9N2J8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q9N2J8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q9N2J8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q9N2J8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q9N2J8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q9N2J8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q9N2J8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q9N2J8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q9N2J8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q9N2J8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Q9N2J8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Q9N2J8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Q9N2J8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Q9N2J8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Q9N2J8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Q9N2J8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Q9N2J8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q9N2J8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q9N2J8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms