Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CENPJQ9HC77 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CENPJQ9HC77 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CENPJQ9HC77 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CENPJQ9HC77 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CENPJQ9HC77 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CENPJQ9HC77 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CENPJQ9HC77 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
CENPJQ9HC77 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CENPJQ9HC77 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CENPJQ9HC77 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CENPJQ9HC77 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CENPJQ9HC77 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CENPJQ9HC77 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CENPJQ9HC77 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CENPJQ9HC77 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CENPJQ9HC77 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CENPJQ9HC77 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CENPJQ9HC77 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CENPJQ9HC77 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CENPJQ9HC77 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CENPJQ9HC77 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CENPJQ9HC77 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
CENPJQ9HC77 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CENPJQ9HC77 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CENPJQ9HC77 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CENPJQ9HC77 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CENPJQ9HC77 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CENPJQ9HC77 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CENPJQ9HC77 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CENPJQ9HC77 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CENPJQ9HC77 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CENPJQ9HC77 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CENPJQ9HC77 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CENPJQ9HC77 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CENPJQ9HC77 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CENPJQ9HC77 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CENPJQ9HC77 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CENPJQ9HC77 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CENPJQ9HC77 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
CENPJQ9HC77 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CENPJQ9HC77 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CENPJQ9HC77 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CENPJQ9HC77 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CENPJQ9HC77 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
CENPJQ9HC77 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
CENPJQ9HC77 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
CENPJQ9HC77 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
CENPJQ9HC77 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
CENPJQ9HC77 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CENPJQ9HC77 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
CENPJQ9HC77 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
CENPJQ9HC77 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
CENPJQ9HC77 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CENPJQ9HC77 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CENPJQ9HC77 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CENPJQ9HC77 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CENPJQ9HC77 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
CENPJQ9HC77 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CENPJQ9HC77 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
CENPJQ9HC77 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
CENPJQ9HC77 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
CENPJQ9HC77 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
CENPJQ9HC77 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
CENPJQ9HC77 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
CENPJQ9HC77 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
CENPJQ9HC77 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
CENPJQ9HC77 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
CENPJQ9HC77 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
CENPJQ9HC77 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CENPJQ9HC77 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CENPJQ9HC77 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CENPJQ9HC77 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
CENPJQ9HC77 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CENPJQ9HC77 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
CENPJQ9HC77 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
CENPJQ9HC77 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
CENPJQ9HC77 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CENPJQ9HC77 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CENPJQ9HC77 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
CENPJQ9HC77 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CENPJQ9HC77 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
CENPJQ9HC77 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
CENPJQ9HC77 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
CENPJQ9HC77 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
CENPJQ9HC77 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
CENPJQ9HC77 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
CENPJQ9HC77 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
CENPJQ9HC77 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
CENPJQ9HC77 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
CENPJQ9HC77 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
CENPJQ9HC77 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
CENPJQ9HC77 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
CENPJQ9HC77 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
CENPJQ9HC77 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
CENPJQ9HC77 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
CENPJQ9HC77 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.76
CENPJQ9HC77 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.76
CENPJQ9HC77 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.76
CENPJQ9HC77 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC32.26■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms