Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBH1

PDF, Peptide deformylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDFQ9HBH1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDFQ9HBH1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDFQ9HBH1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDFQ9HBH1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDFQ9HBH1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDFQ9HBH1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDFQ9HBH1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDFQ9HBH1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDFQ9HBH1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDFQ9HBH1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDFQ9HBH1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDFQ9HBH1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDFQ9HBH1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PDFQ9HBH1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDFQ9HBH1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PDFQ9HBH1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PDFQ9HBH1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDFQ9HBH1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDFQ9HBH1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDFQ9HBH1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDFQ9HBH1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDFQ9HBH1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDFQ9HBH1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDFQ9HBH1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDFQ9HBH1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDFQ9HBH1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PDFQ9HBH1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDFQ9HBH1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDFQ9HBH1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDFQ9HBH1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PDFQ9HBH1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDFQ9HBH1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDFQ9HBH1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDFQ9HBH1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDFQ9HBH1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PDFQ9HBH1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDFQ9HBH1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDFQ9HBH1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDFQ9HBH1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDFQ9HBH1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDFQ9HBH1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PDFQ9HBH1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDFQ9HBH1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDFQ9HBH1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDFQ9HBH1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDFQ9HBH1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDFQ9HBH1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDFQ9HBH1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDFQ9HBH1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PDFQ9HBH1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDFQ9HBH1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDFQ9HBH1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDFQ9HBH1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDFQ9HBH1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDFQ9HBH1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDFQ9HBH1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDFQ9HBH1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDFQ9HBH1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDFQ9HBH1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PDFQ9HBH1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDFQ9HBH1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDFQ9HBH1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDFQ9HBH1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDFQ9HBH1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDFQ9HBH1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDFQ9HBH1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDFQ9HBH1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDFQ9HBH1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDFQ9HBH1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PDFQ9HBH1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDFQ9HBH1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDFQ9HBH1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDFQ9HBH1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PDFQ9HBH1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDFQ9HBH1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDFQ9HBH1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDFQ9HBH1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDFQ9HBH1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDFQ9HBH1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDFQ9HBH1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDFQ9HBH1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDFQ9HBH1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDFQ9HBH1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDFQ9HBH1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDFQ9HBH1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDFQ9HBH1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDFQ9HBH1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDFQ9HBH1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDFQ9HBH1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDFQ9HBH1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDFQ9HBH1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDFQ9HBH1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDFQ9HBH1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDFQ9HBH1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PDFQ9HBH1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDFQ9HBH1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDFQ9HBH1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDFQ9HBH1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDFQ9HBH1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDFQ9HBH1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 415.9 ms