Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBA0

TRPV4, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 4, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPV4Q9HBA0 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRPV4Q9HBA0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRPV4Q9HBA0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRPV4Q9HBA0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRPV4Q9HBA0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRPV4Q9HBA0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRPV4Q9HBA0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRPV4Q9HBA0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRPV4Q9HBA0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRPV4Q9HBA0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRPV4Q9HBA0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRPV4Q9HBA0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRPV4Q9HBA0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRPV4Q9HBA0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRPV4Q9HBA0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRPV4Q9HBA0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRPV4Q9HBA0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRPV4Q9HBA0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRPV4Q9HBA0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRPV4Q9HBA0 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRPV4Q9HBA0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRPV4Q9HBA0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRPV4Q9HBA0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRPV4Q9HBA0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRPV4Q9HBA0 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TRPV4Q9HBA0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TRPV4Q9HBA0 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRPV4Q9HBA0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRPV4Q9HBA0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRPV4Q9HBA0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRPV4Q9HBA0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRPV4Q9HBA0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRPV4Q9HBA0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRPV4Q9HBA0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRPV4Q9HBA0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRPV4Q9HBA0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRPV4Q9HBA0 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRPV4Q9HBA0 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRPV4Q9HBA0 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRPV4Q9HBA0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRPV4Q9HBA0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRPV4Q9HBA0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRPV4Q9HBA0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRPV4Q9HBA0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRPV4Q9HBA0 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRPV4Q9HBA0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRPV4Q9HBA0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRPV4Q9HBA0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRPV4Q9HBA0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRPV4Q9HBA0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRPV4Q9HBA0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRPV4Q9HBA0 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TRPV4Q9HBA0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRPV4Q9HBA0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRPV4Q9HBA0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRPV4Q9HBA0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRPV4Q9HBA0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRPV4Q9HBA0 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRPV4Q9HBA0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TRPV4Q9HBA0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRPV4Q9HBA0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRPV4Q9HBA0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRPV4Q9HBA0 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TRPV4Q9HBA0 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRPV4Q9HBA0 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRPV4Q9HBA0 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRPV4Q9HBA0 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRPV4Q9HBA0 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRPV4Q9HBA0 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRPV4Q9HBA0 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRPV4Q9HBA0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRPV4Q9HBA0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TRPV4Q9HBA0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRPV4Q9HBA0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRPV4Q9HBA0 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRPV4Q9HBA0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRPV4Q9HBA0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRPV4Q9HBA0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRPV4Q9HBA0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRPV4Q9HBA0 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRPV4Q9HBA0 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRPV4Q9HBA0 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TRPV4Q9HBA0 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRPV4Q9HBA0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRPV4Q9HBA0 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TRPV4Q9HBA0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRPV4Q9HBA0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRPV4Q9HBA0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRPV4Q9HBA0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRPV4Q9HBA0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRPV4Q9HBA0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TRPV4Q9HBA0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TRPV4Q9HBA0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRPV4Q9HBA0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRPV4Q9HBA0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRPV4Q9HBA0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRPV4Q9HBA0 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TRPV4Q9HBA0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRPV4Q9HBA0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRPV4Q9HBA0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms