Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBA0

TRPV4, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 4, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPV4Q9HBA0 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRPV4Q9HBA0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRPV4Q9HBA0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRPV4Q9HBA0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRPV4Q9HBA0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRPV4Q9HBA0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRPV4Q9HBA0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRPV4Q9HBA0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRPV4Q9HBA0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRPV4Q9HBA0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRPV4Q9HBA0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRPV4Q9HBA0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRPV4Q9HBA0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRPV4Q9HBA0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRPV4Q9HBA0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRPV4Q9HBA0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRPV4Q9HBA0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRPV4Q9HBA0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRPV4Q9HBA0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRPV4Q9HBA0 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRPV4Q9HBA0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRPV4Q9HBA0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRPV4Q9HBA0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRPV4Q9HBA0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRPV4Q9HBA0 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TRPV4Q9HBA0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TRPV4Q9HBA0 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRPV4Q9HBA0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRPV4Q9HBA0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRPV4Q9HBA0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRPV4Q9HBA0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRPV4Q9HBA0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRPV4Q9HBA0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRPV4Q9HBA0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRPV4Q9HBA0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRPV4Q9HBA0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRPV4Q9HBA0 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRPV4Q9HBA0 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRPV4Q9HBA0 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRPV4Q9HBA0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRPV4Q9HBA0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRPV4Q9HBA0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRPV4Q9HBA0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRPV4Q9HBA0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRPV4Q9HBA0 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRPV4Q9HBA0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRPV4Q9HBA0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRPV4Q9HBA0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRPV4Q9HBA0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRPV4Q9HBA0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRPV4Q9HBA0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRPV4Q9HBA0 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TRPV4Q9HBA0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRPV4Q9HBA0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRPV4Q9HBA0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRPV4Q9HBA0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRPV4Q9HBA0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRPV4Q9HBA0 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRPV4Q9HBA0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TRPV4Q9HBA0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRPV4Q9HBA0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRPV4Q9HBA0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRPV4Q9HBA0 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TRPV4Q9HBA0 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRPV4Q9HBA0 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRPV4Q9HBA0 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRPV4Q9HBA0 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRPV4Q9HBA0 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRPV4Q9HBA0 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRPV4Q9HBA0 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRPV4Q9HBA0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRPV4Q9HBA0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TRPV4Q9HBA0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRPV4Q9HBA0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRPV4Q9HBA0 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRPV4Q9HBA0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRPV4Q9HBA0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRPV4Q9HBA0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRPV4Q9HBA0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRPV4Q9HBA0 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRPV4Q9HBA0 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRPV4Q9HBA0 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TRPV4Q9HBA0 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRPV4Q9HBA0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRPV4Q9HBA0 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TRPV4Q9HBA0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRPV4Q9HBA0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRPV4Q9HBA0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRPV4Q9HBA0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRPV4Q9HBA0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRPV4Q9HBA0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TRPV4Q9HBA0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TRPV4Q9HBA0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRPV4Q9HBA0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRPV4Q9HBA0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRPV4Q9HBA0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRPV4Q9HBA0 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TRPV4Q9HBA0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRPV4Q9HBA0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRPV4Q9HBA0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms