Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAS3

SLC28A3, Solute carrier family 28 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC28A3Q9HAS3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC28A3Q9HAS3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC28A3Q9HAS3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC28A3Q9HAS3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC28A3Q9HAS3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC28A3Q9HAS3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC28A3Q9HAS3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC28A3Q9HAS3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC28A3Q9HAS3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC28A3Q9HAS3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC28A3Q9HAS3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC28A3Q9HAS3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC28A3Q9HAS3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC28A3Q9HAS3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC28A3Q9HAS3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC28A3Q9HAS3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC28A3Q9HAS3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC28A3Q9HAS3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC28A3Q9HAS3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC28A3Q9HAS3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC28A3Q9HAS3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC28A3Q9HAS3 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC28A3Q9HAS3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC28A3Q9HAS3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC28A3Q9HAS3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC28A3Q9HAS3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC28A3Q9HAS3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC28A3Q9HAS3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC28A3Q9HAS3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC28A3Q9HAS3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC28A3Q9HAS3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC28A3Q9HAS3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC28A3Q9HAS3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC28A3Q9HAS3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC28A3Q9HAS3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC28A3Q9HAS3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC28A3Q9HAS3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC28A3Q9HAS3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC28A3Q9HAS3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC28A3Q9HAS3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC28A3Q9HAS3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC28A3Q9HAS3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC28A3Q9HAS3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC28A3Q9HAS3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC28A3Q9HAS3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC28A3Q9HAS3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC28A3Q9HAS3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC28A3Q9HAS3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC28A3Q9HAS3 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC28A3Q9HAS3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC28A3Q9HAS3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC28A3Q9HAS3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC28A3Q9HAS3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC28A3Q9HAS3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC28A3Q9HAS3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC28A3Q9HAS3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC28A3Q9HAS3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC28A3Q9HAS3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC28A3Q9HAS3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC28A3Q9HAS3 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC28A3Q9HAS3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC28A3Q9HAS3 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC28A3Q9HAS3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC28A3Q9HAS3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC28A3Q9HAS3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC28A3Q9HAS3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC28A3Q9HAS3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC28A3Q9HAS3 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC28A3Q9HAS3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC28A3Q9HAS3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC28A3Q9HAS3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC28A3Q9HAS3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SLC28A3Q9HAS3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC28A3Q9HAS3 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC28A3Q9HAS3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC28A3Q9HAS3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC28A3Q9HAS3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC28A3Q9HAS3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC28A3Q9HAS3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC28A3Q9HAS3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC28A3Q9HAS3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC28A3Q9HAS3 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC28A3Q9HAS3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC28A3Q9HAS3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC28A3Q9HAS3 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC28A3Q9HAS3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC28A3Q9HAS3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC28A3Q9HAS3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC28A3Q9HAS3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC28A3Q9HAS3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC28A3Q9HAS3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC28A3Q9HAS3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC28A3Q9HAS3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC28A3Q9HAS3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC28A3Q9HAS3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC28A3Q9HAS3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC28A3Q9HAS3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC28A3Q9HAS3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC28A3Q9HAS3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC28A3Q9HAS3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms