Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7F0

ATP13A3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, humanhuman

Predictions only

Length 1,226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP13A3Q9H7F0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP13A3Q9H7F0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP13A3Q9H7F0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP13A3Q9H7F0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP13A3Q9H7F0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP13A3Q9H7F0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP13A3Q9H7F0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP13A3Q9H7F0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP13A3Q9H7F0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP13A3Q9H7F0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP13A3Q9H7F0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP13A3Q9H7F0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP13A3Q9H7F0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP13A3Q9H7F0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP13A3Q9H7F0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP13A3Q9H7F0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP13A3Q9H7F0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP13A3Q9H7F0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP13A3Q9H7F0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP13A3Q9H7F0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP13A3Q9H7F0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP13A3Q9H7F0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP13A3Q9H7F0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP13A3Q9H7F0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP13A3Q9H7F0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP13A3Q9H7F0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP13A3Q9H7F0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP13A3Q9H7F0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP13A3Q9H7F0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP13A3Q9H7F0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP13A3Q9H7F0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP13A3Q9H7F0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP13A3Q9H7F0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP13A3Q9H7F0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ATP13A3Q9H7F0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP13A3Q9H7F0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP13A3Q9H7F0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP13A3Q9H7F0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP13A3Q9H7F0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP13A3Q9H7F0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP13A3Q9H7F0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP13A3Q9H7F0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP13A3Q9H7F0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP13A3Q9H7F0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP13A3Q9H7F0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP13A3Q9H7F0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP13A3Q9H7F0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP13A3Q9H7F0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP13A3Q9H7F0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP13A3Q9H7F0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP13A3Q9H7F0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP13A3Q9H7F0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP13A3Q9H7F0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP13A3Q9H7F0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP13A3Q9H7F0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP13A3Q9H7F0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP13A3Q9H7F0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP13A3Q9H7F0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP13A3Q9H7F0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP13A3Q9H7F0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP13A3Q9H7F0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP13A3Q9H7F0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP13A3Q9H7F0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP13A3Q9H7F0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP13A3Q9H7F0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP13A3Q9H7F0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP13A3Q9H7F0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP13A3Q9H7F0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP13A3Q9H7F0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP13A3Q9H7F0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP13A3Q9H7F0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP13A3Q9H7F0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP13A3Q9H7F0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP13A3Q9H7F0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP13A3Q9H7F0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP13A3Q9H7F0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP13A3Q9H7F0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP13A3Q9H7F0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP13A3Q9H7F0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP13A3Q9H7F0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP13A3Q9H7F0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP13A3Q9H7F0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP13A3Q9H7F0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP13A3Q9H7F0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP13A3Q9H7F0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP13A3Q9H7F0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP13A3Q9H7F0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP13A3Q9H7F0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP13A3Q9H7F0 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP13A3Q9H7F0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP13A3Q9H7F0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP13A3Q9H7F0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP13A3Q9H7F0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP13A3Q9H7F0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP13A3Q9H7F0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP13A3Q9H7F0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP13A3Q9H7F0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP13A3Q9H7F0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP13A3Q9H7F0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP13A3Q9H7F0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.2 ms