Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6T3

RPAP3, RNA polymerase II-associated protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP3Q9H6T3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RPAP3Q9H6T3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RPAP3Q9H6T3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RPAP3Q9H6T3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RPAP3Q9H6T3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RPAP3Q9H6T3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RPAP3Q9H6T3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
RPAP3Q9H6T3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RPAP3Q9H6T3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RPAP3Q9H6T3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RPAP3Q9H6T3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RPAP3Q9H6T3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RPAP3Q9H6T3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RPAP3Q9H6T3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
RPAP3Q9H6T3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
RPAP3Q9H6T3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
RPAP3Q9H6T3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RPAP3Q9H6T3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RPAP3Q9H6T3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RPAP3Q9H6T3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RPAP3Q9H6T3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RPAP3Q9H6T3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RPAP3Q9H6T3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RPAP3Q9H6T3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RPAP3Q9H6T3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RPAP3Q9H6T3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RPAP3Q9H6T3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RPAP3Q9H6T3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RPAP3Q9H6T3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RPAP3Q9H6T3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
RPAP3Q9H6T3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RPAP3Q9H6T3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
RPAP3Q9H6T3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RPAP3Q9H6T3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RPAP3Q9H6T3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RPAP3Q9H6T3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RPAP3Q9H6T3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RPAP3Q9H6T3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
RPAP3Q9H6T3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RPAP3Q9H6T3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RPAP3Q9H6T3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RPAP3Q9H6T3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RPAP3Q9H6T3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
RPAP3Q9H6T3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RPAP3Q9H6T3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RPAP3Q9H6T3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RPAP3Q9H6T3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RPAP3Q9H6T3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
RPAP3Q9H6T3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RPAP3Q9H6T3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
RPAP3Q9H6T3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RPAP3Q9H6T3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RPAP3Q9H6T3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RPAP3Q9H6T3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RPAP3Q9H6T3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RPAP3Q9H6T3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RPAP3Q9H6T3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RPAP3Q9H6T3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RPAP3Q9H6T3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RPAP3Q9H6T3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RPAP3Q9H6T3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RPAP3Q9H6T3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RPAP3Q9H6T3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RPAP3Q9H6T3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
RPAP3Q9H6T3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RPAP3Q9H6T3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RPAP3Q9H6T3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RPAP3Q9H6T3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RPAP3Q9H6T3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RPAP3Q9H6T3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RPAP3Q9H6T3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RPAP3Q9H6T3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
RPAP3Q9H6T3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RPAP3Q9H6T3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RPAP3Q9H6T3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RPAP3Q9H6T3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
RPAP3Q9H6T3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RPAP3Q9H6T3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RPAP3Q9H6T3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RPAP3Q9H6T3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RPAP3Q9H6T3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RPAP3Q9H6T3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RPAP3Q9H6T3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RPAP3Q9H6T3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RPAP3Q9H6T3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RPAP3Q9H6T3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RPAP3Q9H6T3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RPAP3Q9H6T3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RPAP3Q9H6T3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RPAP3Q9H6T3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RPAP3Q9H6T3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RPAP3Q9H6T3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RPAP3Q9H6T3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RPAP3Q9H6T3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RPAP3Q9H6T3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RPAP3Q9H6T3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RPAP3Q9H6T3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RPAP3Q9H6T3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RPAP3Q9H6T3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RPAP3Q9H6T3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms